أنهى أندرسون كوبر وشريكه السابق بنجامين ميساني علاقتهما العاطفية في عام 2018 لكنهما حافظا على الروابط العائلية. ويشترك الاثنان في تربية ابني كوبر، ويات وسيباستيان، في نيويورك. وقد وصف مذيع شبكة CNN ميساني بأنه فرد من العائلة على الرغم من الانفصال.
واعد أندرسون كوبر وبنجامين ميساني بعضهما البعض في الفترة ما بين عامي 2009 و2018. وأعلن كوبر عن الانفصال في مارس من ذلك العام، مصرحاً لبرنامج إنترتينمنت تونايت بأنهما لا يزالان عائلة ويحبان بعضهما كثيراً. وقد حافظ الثنائي على خصوصية علاقتهما إلى حد كبير حتى أعلناها للجمهور في عام 2015.
