La moitié des 16 villes de la Région capitale nationale a cessé d'utiliser des fonds confidentiels en 2024, entraînant une baisse de 35 % des dépenses totales, passant de 748,49 millions de P en 2023 à 483,93 millions de P. Ce changement reflète des efforts plus larges pour une plus grande transparence dans les budgets locaux. Par exemple, la ville de Makati a signalé aucune dépense confidentielle cette année, inversant ainsi les 240 millions de P de l'année précédente.
En 2024, huit villes de NCR — notamment Makati, Malabon, Pasig, Las Piñas, Mandaluyong, Navotas, Taguig et Valenzuela — ont décidé de renoncer aux dépenses de fonds confidentiels, contribuant à une baisse significative des dépenses régionales. Makati, précédemment le plus gros dépensier avec 240 millions de P en 2023, a signalé zéro dépense de ce type cette année. De même, Malabon a éliminé toutes les avances de trésorerie pour ces fonds, contre 13,7 millions de P l'année précédente.
Pendant ce temps, huit villes ont continué à les utiliser : Manille (120 millions de P les deux années), Pasay (80 millions de P), Quezon City (de 100 millions de P à 75 millions de P), Caloocan (60 millions de P à 70,5 millions de P), Parañaque (49,5 millions de P stable), Muntinlupa (de 44,29 millions de P à 47,93 millions de P), Marikina (25 millions de P) et San Juan (16 millions de P).
Ce changement découle d'un examen approfondi des fonds confidentiels en 2023, en particulier concernant la dépense de la vice-présidente Sara Duterte de 125 millions de P en seulement 11 jours en décembre 2022, malgré aucune allocation dans le budget national de 2022. Le 12 décembre 2023, des groupes de la société civile ont déposé une plainte pour pillage contre elle pour détournement présumé de 612,5 millions de P en tant que vice-présidente et secrétaire à l'Éducation. À Davao City, qu'elle a dirigée en tant que maire, les dépenses confidentielles ont bondi de 144 millions de P en 2016 à plus de 2,6 milliards de P à la fin de son mandat en 2022.
Duterte a fait face à des procédures d'impeachment et a refusé d'expliquer l'utilisation des fonds devant le Congrès. Le 8 août 2024, la Commission d'audit a émis un avis de disallowance pour 73 millions de P de dépenses confidentielles du Bureau de la vice-présidente en 2022 en raison d'un manque de preuves. Selon la Circulaire conjointe n° 2015-01, ces fonds sont limités aux initiatives de paix et d'ordre public, telles que la prévention de la criminalité, la formation des forces de l'ordre et les programmes contre les drogues illégales, le jeu, l'insurrection, la contrebande, la traite des êtres humains, la pêche illégale et l'exploitation minière ou l'abattage non autorisés.