Inutus ni Pangulong Ferdinand Marcos Jr. ang Department of Public Works and Highways at ang Independent Commission for Infrastructure na ihatid sa Ombudsman ang lahat ng ebidensya mula sa kanilang imbestigasyon sa mga anomalya sa proyekto ng flood control. Ito ay kasabay ng rekomendasyon ng dalawang ahensya na mag-file ng mga kaso ng plunder, graft, at bribery laban sa dating House Speaker Martin Romualdez at dating kongresista Zaldy Co. Ang desisyon ng Ombudsman ay batay sa ebidensya mula sa mga kontrata at testimonya.
Noong Nobyembre 21, 2025, sa Manila, naglabas ng video message si Pangulong Ferdinand Marcos Jr. sa pamamagitan ng Presidential Communications Office, na nag-utos sa DPWH at ICI na ipasa sa Ombudsman ang lahat ng nakuha nilang ebidensya mula sa tatlong buwang imbestigasyon sa mga iregular na gawa sa flood control. Ayon kay Marcos, 'Once all the evidence is reviewed, the Ombudsman may file plunder, anti-graft, or indirect bribery charges. The Ombudsman simply follows where the evidence leads.'
Ang DPWH Secretary Vince Dizon ay naglista ng potensyal na paglabag: plunder sa ilalim ng Republic Act 7080; mga paglabag sa Sections 3(A), (B), (E), at (H) ng Anti-Graft and Corrupt Practices Act; at direct bribery sa ilalim ng Article 210 ng Revised Penal Code. Ang mga rekomendasyon ay nagmula sa mga kontrata ng Sunwest Inc. at Hi-Tone Construction mula 2016 hanggang 2025, pati na ang sworn testimony ni retired Sgt. Orly Guteza, na dating security aide ni Co, na nagpatotoo na naghatid siya ng mga bagahe na puno ng pera sa mga tahanan nina Romualdez at Co, batay sa Senate Blue Ribbon Committee hearings.
Si Romualdez, pinsan ni Marcos at dating House Speaker hanggang Setyembre 2025, ay nag-resign dahil sa eskandalo sa flood control funds. Si Co, dating chair ng House appropriations committee at dating Ako Bicol representative, ay nasa abroad mula Hulyo 2025 at nag-resign mula sa Kongreso; siya rin ang paksa ng unang kaso ng flood control corruption na nai-file sa Sandiganbayan. Isang naunang ulat ay naghayag na ang Sunwest ni Co ay nanalo ng bilyun-bilyong kontrata ng DPWH sa distrito ni Romualdez sa Leyte.
Ang ICI, isang ad hoc body na ginawa ni Marcos upang imbestigahan ang mga proyekto ng imprastraktura sa loob ng isang dekada, ay nagbigay-diin sa siphoning ng bilyun-bilyong piso para sa flood control. Noong Setyembre, nangako si Marcos na walang exemption kahit si Romualdez. Ang Ombudsman, dating Justice Secretary Jesus Crispin Remulla, ay maaaring mag-file ng mga kaso laban kay Romualdez sa loob ng anim hanggang siyam na buwan.