CachyOS telah menggantikan Octopi dengan Shelly, manajer paket grafis baru berbasis Rust, sebagai alat bawaan untuk menangani instalasi perangkat lunak dari berbagai sumber.
Distribusi yang dikenal karena optimalisasi kinerjanya ini kini menawarkan antarmuka terpadu bagi pengguna untuk mengelola paket dari repositori mereka sendiri, Arch User Repository (AUR), file AppImage, serta Flathub. Shelly menampilkan aktivitas terkini dan dasbor yang menunjukkan paket yang terpasang dari AUR dan Flatpak, beserta status pembaruan secara keseluruhan. Bilah pencarian di bagian atas menelusuri semua sumber yang didukung secara bersamaan dan mengurutkan hasil berdasarkan preferensi, dimulai dari repositori resmi. Pengaturan aplikasi memungkinkan pengguna untuk mengaktifkan dukungan AUR, Flatpak, dan AppImage, serta opsi lanjutan seperti menonaktifkan prompt konfirmasi dan membatasi unduhan paralel. Aplikasi ini juga menyertakan fitur pembersihan (purify) untuk menghapus paket yang rusak. Pengujian menunjukkan pengoperasian yang andal untuk paket repositori, AUR, dan Flathub, sementara penanganan AppImage memberikan hasil yang beragam, di mana beberapa file terintegrasi ke dalam menu sistem dan yang lainnya tidak.