En el cuarto episodio de la segunda temporada de X-Men '97, Apocalipsis utiliza su armadura celestial para desintegrar a Magneto. Tras el ataque, solo queda el casco del mutante. La escena se produce después de la masacre de Genosha ocurrida al principio de la serie.
El suceso tiene lugar al final del episodio titulado "El ascenso de Apocalipsis, segunda parte". Apocalipsis atrapa a Magneto y lo elimina frente al Profesor Xavier.
Magneto ya parecía haber muerto durante los hechos de Genosha en la primera temporada, pero regresó con vida dos episodios después. El énfasis prolongado en la nueva escena y la reacción del Profesor Xavier sugieren que este suceso podría tener mayor relevancia.
En los cómics, Magneto ha fallecido en múltiples ocasiones, incluyendo en X-Men: Red #5 de 2022 y en la serie de 2024 La resurrección de Magneto.