La Mission d'observation électorale et d'autres entités ont présenté des mises à jour sur la journée de vote du 21 juin, alertant sur des irrégularités et des perturbations isolées.
La Mission d'observation électorale a rapporté que le processus s'est déroulé dans une normalité générale à travers 1 868 bureaux de vote observés. Elle a noté une diminution des insignes de campagne portés par les jurés et les témoins, tout en signalant un manque de matériel accessible aux personnes en situation de handicap et deux cas de traitement discriminatoire. Le Bureau du procureur général a reçu 521 signalements de comportements susceptibles d'affecter les élections et a déclaré que près de 14 000 jurés désignés ne se sont pas présentés dans 401 municipalités. Le ministère de l'Intérieur a fait état de 2 612 plaintes au total, dont 153 provenant de l'étranger. Le ministère des Technologies de l'information et des Communications a détecté des perturbations des services de télécommunications dans 30 municipalités réparties sur 18 départements, sans impact sur les systèmes de transmission électorale. Le Registre national a rejeté les allégations du président Gustavo Petro concernant des défauts dans les formulaires E-14.