Dopo essere stato costretto a lasciare la posizione di viceministro della Giustizia, Sebastián Amerio diventerà il nuovo procuratore del Tesoro in una ristrutturazione guidata da Karina Milei. Juan Bautista Mahiques ha assunto l'incarico di ministro della Giustizia e ha richiesto dimissioni di massa dai funzionari. La mossa evidenzia tensioni interne in La Libertad Avanza tra Karina Milei e Santiago Caputo.
Juan Bautista Mahiques ha assunto la carica di ministro della Giustizia il 5 marzo 2026, con l'approvazione di Karina Milei, e ha immediatamente richiesto le dimissioni dei capi di agenzie chiave come l'Ufficio Anticorruzione, l'Unità di Informazione Finanziaria e l'Ispezione Generale di Giustizia. Questo mira a collocare figure leali in aree sensibili, sebbene la Procura del Tesoro sia rimasta intatta per la sua delicatezza nelle liti statali. Sebastián Amerio, considerato vicino a Santiago Caputo, lascia il viceministero per sostituire Santiago Castro Videla come procuratore del Tesoro, permettendo a Caputo di mantenere l'influenza nonostante la sconfitta interna libertaria. Santiago Viola, altro alleato di Karina Milei e della famiglia Menem, assumerà la Segreteria di Giustizia e rappresenterà l'Esecutivo nel Consiglio della Magistratura per accelerare il riempimento di oltre 300 vacanti giudiziarie. Mahiques ha sottolineato sul suo account X la necessità di una giustizia indipendente e imparziale: «Senza giustizia, non c'è futuro possibile. Quel percorso richiede istituzioni che funzionino in conformità allo stato di diritto». Ha ringraziato Javier Milei, Karina Milei e il predecessore Mariano Cúneo Libarona. Il deputato Rodolfo Tailhade ha criticato i cambiamenti in un programma di Canal E, affermando che Karina Milei delega il controllo a una «corporazione giudiziaria» legata a Comodoro Py, con possibili legami all'era Macri e rischi di persecuzione dell'opposizione. Tailhade ha indicato reti di operatori giudiziari con influenza politica, citando lo scandalo Lago Escondido come esempio di queste dinamiche. La pianificazione è stata condotta segretamente tra Karina Milei e Caputo, privilegiando le nomine giudiziarie che richiedono solo la maggioranza semplice in Senato.