Le département du Huila a enregistré en 2024 des taux de mortalité situés entre 16 % et 29 % au-dessus de la moyenne nationale, selon un rapport de l'Association colombienne des entreprises de médecine intégrale.
Le bulletin Salud en Cifras, publié le 23 mai 2026, a analysé les données du secteur de la santé de 2015 à 2024. Le Huila se classe aux côtés du Guaviare, de Risaralda et du Quindío parmi les départements présentant une mortalité plus élevée, principalement due aux crises cardiaques, aux homicides et aux maladies cérébrovasculaires.
En matière de vaccination, le Huila affiche des niveaux de couverture intermédiaires. La troisième dose du vaccin pentavalent chez les enfants de moins d'un an reste inférieure à la moyenne nationale de 91,6 %, loin de l'objectif de 95 %. La couverture contre le papillomavirus humain atteint 54,7 % chez les filles et 44,7 % chez les garçons.
Le rapport note également une augmentation de 166,8 % des problèmes de santé mentale au cours de la dernière décennie et une hausse de 78,5 % des cas de cancer entre 2015 et 2024.