Captain Jonathan Archers Werdegang nach Star Trek: Enterprise etabliert ihn als Eckpfeiler der Star-Trek-Geschichte, indem er vom Captain zum Admiral, Botschafter und Präsidenten der Vereinigten Föderation der Planeten aufsteigt, wie im Serienfinale und in Episoden wie 'In a Mirror, Darkly' angedeutet.
Star Trek: Enterprise endete 2005 damit, dass Captain Jonathan Archer (Scott Bakula) vom Kommando der NX-01 zu höheren Verantwortungen überging. Das Serienfinale „These Are the Voyages...“ zeigt Archer, wie er sein Kapitänamt aufgibt, um Rollen bei der Gründung der Vereinigten Föderation der Planeten zu übernehmen. Kannonguellen umreißen seine Beförderungen: Archer wird Admiral in Starfleet und dient als Stabschef beim Starfleet Command. Später wirkt er als Botschafter, bevor er 2184 zum Präsidenten der Vereinigten Föderation der Planeten gewählt wird. Archer lebt lange genug, um 2245 der Stapellauf der USS Enterprise NCC-1701 beizuwohnen, des Schiffs, das Generationen später von Captain Kirk kommandiert wird. Früher in der Serie referenzieren die Spiegeluniversum-Episoden der 4. Staffel „In a Mirror, Darkly“ (Teile 1 und 2) Archer in Aufzeichnungen des 22. Jahrhunderts als „den größten Erkunder des 22. Jahrhunderts“, was sein Vermächtnis zementiert. Dieser Weg verbindet Enterprise mit der breiteren Star-Trek-Zeitlinie und beeinflusst die Kontinuität des Franchises.