La trajectoire du capitaine Jonathan Archer après Star Trek: Enterprise l'établit comme une pierre angulaire de l'histoire Star Trek, en le faisant passer du rang de capitaine à celui d'amiral, d'ambassadeur et de président de la Fédération unie des planètes, comme préfiguré dans le final de la série et des épisodes comme « In a Mirror, Darkly ».
Star Trek: Enterprise s'est conclue en 2005 avec le capitaine Jonathan Archer (Scott Bakula) passant du commandement du NX-01 à des responsabilités plus élevées. Le final de la série, « These Are the Voyages... », montre Archer quittant son poste de capitaine pour des rôles dans la fondation de la Fédération unie des planètes. Les sources canoniques détaillent ses promotions : Archer devient amiral au sein de Starfleet, servant comme chef d'état-major au quartier général de Starfleet. Il agit ensuite comme ambassadeur avant d'être élu président de la Fédération unie des planètes en 2184. Archer vit assez longtemps pour assister à la cérémonie de baptême de l'USS Enterprise NCC-1701 en 2245, le vaisseau commandé par le capitaine Kirk plusieurs générations plus tard. Plus tôt dans la série, les épisodes de la saison 4 dans l'univers miroir « In a Mirror, Darkly » (parties 1 et 2) mentionnent Archer dans des archives du XXIIe siècle comme « le plus grand explorateur du XXIIe siècle », consolidant ainsi son legs. Ce parcours relie Enterprise à la chronologie plus large de Star Trek, influençant la continuité de la franchise.