Peneliti di Mass General Brigham telah mengembangkan HPV-DeepSeek, tes darah yang sangat sensitif yang mengidentifikasi kanker kepala dan leher terkait HPV hampir satu dekade sebelum gejala muncul. Tes ini menggunakan sekuensing genom lengkap untuk mendeteksi fragmen DNA virus dalam aliran darah. Kemajuan ini dapat memungkinkan pengobatan lebih dini dan meningkatkan hasil pasien.
Virus papiloma manusia (HPV) menyebabkan sekitar 70% kanker kepala dan leher di Amerika Serikat, yang frekuensinya meningkat. Tidak seperti kanker serviks, tidak ada skrining rutin untuk kanker terkait HPV ini, yang menyebabkan diagnosis hanya setelah tumor tumbuh besar dan menyebar, seringkali ke kelenjar getah bening.
Sebuah studi yang diterbitkan di Journal of the National Cancer Institute memperkenalkan HPV-DeepSeek, tes biopsi cair yang dikembangkan oleh tim di Mass General Brigham. Tes ini mengidentifikasi jejak DNA HPV dari tumor dalam darah, mencapai sensitivitas dan spesifisitas 99% dalam penelitian sebelumnya untuk mendeteksi kanker pada presentasi klinis.
Untuk menilai potensi deteksi dini, peneliti menganalisis 56 sampel darah dari Mass General Brigham Biobank: 28 dari individu yang kemudian mengembangkan kanker kepala dan leher terkait HPV dan 28 dari kontrol sehat. HPV-DeepSeek mendeteksi DNA tumor pada 22 dari 28 sampel pra-diagnosis, dengan semua kontrol negatif. Menggunakan peningkatan pembelajaran mesin, deteksi meningkat menjadi 27 dari 28 kasus, termasuk sampel hingga 10 tahun sebelum diagnosis. Hasil positif tanpa bantuan terawal adalah 7,8 tahun sebelumnya.
"Studi kami menunjukkan untuk pertama kalinya bahwa kita dapat mendeteksi kanker terkait HPV secara akurat pada individu tanpa gejala bertahun-tahun sebelum mereka didiagnosis dengan kanker," kata penulis utama Daniel L. Faden, MD, FACS, onkolog bedah kepala dan leher di Mass Eye and Ear. Ia mencatat bahwa diagnosis terlambat sering memerlukan pengobatan dengan efek samping seumur hidup, dan deteksi dini melalui alat seperti HPV-DeepSeek dapat mengurangi intervensi agresif dan meningkatkan kualitas hidup.
Temuan ini sedang divalidasi dalam studi buta yang didanai oleh National Institutes of Health menggunakan ratusan sampel dari Prostate, Lung, Colorectal, and Ovarian Cancer Screening Trial.