Forskare vid Mass General Brigham har utvecklat HPV-DeepSeek, ett mycket känsligt blodprov som identifierar HPV-associerade huvud- och halscancerformer nästan ett decennium innan symtom uppstår. Testet använder helgenomsekvensering för att upptäcka virala DNA-fragment i blodet. Detta framsteg kan möjliggöra tidigare behandlingar och förbättra patientutfall.
Humant papillomvirus (HPV) orsakar cirka 70 % av huvud- och halscancer i USA, som ökar i frekvens. Till skillnad från livmoderhalscancer finns ingen rutinmässig screening för dessa HPV-relaterade cancerformer, vilket leder till diagnoser först efter att tumörer vuxit sig stora och spridit sig, ofta till lymfkörtlar.
En studie publicerad i Journal of the National Cancer Institute introducerar HPV-DeepSeek, ett vätskebiopsitest utvecklat av ett team vid Mass General Brigham. Testet identifierar spår av HPV-DNA från tumörer i blodet och uppnår 99 % känslighet och specificitet i tidigare forskning för att upptäcka cancer vid klinisk presentation.
För att bedöma potentialen för tidig detektion analyserade forskarna 56 blodprover från Mass General Brigham Biobank: 28 från individer som senare utvecklade HPV-associerad huvud- och halscancer och 28 från friska kontroller. HPV-DeepSeek upptäckte tumör-DNA i 22 av 28 pre-diagnostiska prover, med alla kontroller negativa. Med hjälp av maskininlärningsförbättringar förbättrades detektionen till 27 av 28 fall, inklusive prover upp till 10 år innan diagnos. Det tidigaste oassisterade positiva resultatet var 7,8 år tidigare.
"Vår studie visar för första gången att vi kan upptäcka HPV-associerade cancerformer exakt hos asymtomatiska individer många år innan de diagnostiseras med cancer", sade huvudförfattaren Daniel L. Faden, MD, FACS, en huvud- och halskirurgisk onkolog vid Mass Eye and Ear. Han noterade att sena diagnoser ofta kräver behandlingar med livslånga biverkningar, och tidig detektion via verktyg som HPV-DeepSeek kan minska aggressiva ingrepp och förbättra livskvaliteten.
Resultaten valideras i en blindad studie finansierad av National Institutes of Health med hundratals prover från Prostate, Lung, Colorectal, and Ovarian Cancer Screening Trial.