Capcom släppte en oanmäld uppdatering för Ultimate Marvel vs. Capcom 3 på Steam den 15 juni. Uppdateringen innehöll buggfixar och kompatibilitet för Windows 11, men inaktiverade av misstag Dark Phoenix-mekaniken för karaktären Phoenix.
Uppdateringen markerar de första patchnoteringarna för spelet sedan 2017. Den åtgärdade den långvariga Kubota Escape-exploiten men introducerade ett nytt problem där Phoenix inte längre kan förvandlas till Dark Phoenix, trots en full Hyper Combo-mätare. Spelare har rapporterat att ändringen beror på en justerad kodkontroll som kräver mer än fem mätarsegment, vilket överskrider maxgränsen. Andra buggar, såsom Franks zombie-plungers, förblir olösta medan flera community-moddar slutade fungera på grund av uppdateringen. Community-medlemmar på Reddit och Discord har uttryckt frustration över det oavsiktliga borttagandet av en central spelmekanik. Capcom har ännu inte kommenterat uppdateringen eller meddelat några planer på en snabbfix.