UC San Diegoの研究者たちは、機械学習を分子および動物研究と組み合わせ、免疫センサーNOD2がタンパク質girdin（GIV/CCDC88Aとしても知られる）とペアを組み、腸の炎症を抑制することを示した；NOD2における一般的なクローン病関連のフレームシフトがこの結合を阻害し、マクロファージをプロ炎症状態へ傾ける。査読済みの発見は、2025年10月2日にJournal of Clinical Investigationに掲載され、マウス大腸炎および敗血症モデルで検証された。
クローン病は、炎症性腸疾患の一形態であり、腸の健康を維持する炎症性および修復性マクロファージのバランスの崩れを伴う。炎症性マクロファージが優勢になると、慢性炎症が腸壁を損傷し、痛みや下痢などの症状を引き起こす。(sciencedaily.com)
UC San Diego School of Medicineの細胞・分子医学教授であるPradipta Ghosh, M.D.が率いるチームは、AIを使用して、健康およびIBD影響下の結腸組織からの数千のマクロファージ遺伝子発現プロファイルを分析した。このアプローチは、炎症性マクロファージと修復性マクロファージを一貫して区別する53遺伝子シグネチャを特定した。(sciencedaily.com)
この研究は、2001年にクローン病リスク増加と最初に結びつけられたNOD2、および53のシグネチャ遺伝子の1つであるgirdin（GIV/CCDC88A）に焦点を当てた。非炎症性マクロファージでは、NOD2がgirdinに結合し、細菌の感知、微生物の除去、腸のホメオスタシスの維持を助ける。(sciencedaily.com)
Journal of Clinical Investigationのメカニスティック実験は、girdinのC末端がNOD2の末端ロイシンリッチリピート（LRR#10）に結合することを示す。クローン病関連のNOD2フレームシフト変異体（1007fs/3020insC）はこのLRR#10領域を欠き、girdinに結合できない—NOD2の炎症抑制および微生物除去能力を損なう。(jci.org)
「NOD2は体内の感染監視システムとして機能します」とGhosh氏は述べた。「girdinに結合すると、侵入病原体を検知し、それらを迅速に中和することで腸の免疫バランスを維持します。このパートナーシップがなければ、NOD2監視システムは崩壊します。」(today.ucsd.edu)
in vivoでの生物学をテストするため、研究者たちは骨髄細胞でgirdinを枯渇させた大腸炎および敗血症のマウスモデルを使用した。これらのモデルは、腸炎症の増強、マイクロバイオームのシフト、NOD2の保護効果の喪失、および敗血症による死亡率の増加を示した。(dx.doi.org)
「腸は戦場であり、マクロファージは平和維持者です」と、共同第一著者のGajanan D. Katkar, Ph.D.、UC San Diego School of Medicineの助教授プロジェクトサイエンティストは述べた。「初めて、AIが2つの対立するチームのプレーヤーを明確に定義し、追跡することを可能にしました。」(today.ucsd.edu)
AI駆動のトランスクリプトミクス、生化学、および動物研究を組み合わせることで、この研究はNOD2が腸炎症にどのように影響するかという長年の疑問に答え、NOD2–girdin相互作用を回復することを目的とした潜在的な治療法を指摘する。研究は2025年10月2日にJournal of Clinical Investigationに掲載された（DOI: 10.1172/JCI190851）。(sciencedaily.com)