Subnautica 2 a suscité un débat parmi les joueurs concernant ses options limitées pour faire face aux créatures marines hostiles. Beaucoup estiment que les outils actuels, tels que les fusées éclairantes, les laissent trop vulnérables durant cette phase d'accès anticipé. Les développeurs de chez Unknown Worlds restent attachés aux thèmes pacifistes du jeu.
Les joueurs ont exprimé leur frustration depuis le récent lancement du jeu en accès anticipé. Les discussions au sein de la communauté sur Reddit et Discord soulignent des plaintes selon lesquelles de petits prédateurs comme le Bullethead et le Marrowbreach interrompent les tâches sans autre contre-mesure efficace que la fuite à la nage ou l'utilisation de fusées éclairantes. Un utilisateur de Reddit a écrit qu'il regrettait la possibilité de se défendre comme dans le Subnautica original, où un couteau offrait une protection de base contre la faune marine agressive.