Subnautica 2 hat unter Spielern eine Debatte über die begrenzten Möglichkeiten im Umgang mit feindseligen Meeresbewohnern ausgelöst. Viele haben das Gefühl, dass die aktuellen Hilfsmittel wie Leuchtfackeln sie während des Early Access zu verwundbar machen. Die Entwickler bei Unknown Worlds halten an den pazifistischen Themen des Spiels fest.
Seit dem kürzlichen Start des Spiels im Early Access haben Spieler ihren Frust geäußert. Community-Diskussionen auf Reddit und Discord heben Beschwerden darüber hervor, dass kleine Raubfische wie Bullethead und Marrowbreach Aufgaben unterbrechen, ohne dass es eine wirksame Gegenmaßnahme gibt, außer wegzuschwimmen oder Leuchtfackeln zu benutzen. Ein Reddit-Nutzer schrieb, er vermisse die Möglichkeit, sich wie im ursprünglichen Subnautica verteidigen zu können, wo ein Messer grundlegenden Schutz gegen aggressive Meeresbewohner bot.