Para peneliti melaporkan peta interaksi tingkat residu di dalam sel antara protein influenza A dan protein manusia, yang menguraikan bagaimana infeksi dapat mengganggu paraspeckle nukleus dan berpotensi melepaskan faktor inang yang mendukung replikasi virus.
Para peneliti yang berbasis di EMBL Hamburg, bekerja sama dengan kolaborator di Leibniz Research Institute for Molecular Pharmacology (FMP), telah melaporkan peta kontak beresolusi tinggi antara protein virus influenza A dan protein manusia di dalam sel yang terinfeksi.
Menggunakan spektrometri massa lintas-taut (cross-linking mass spectrometry) dalam sel pada sel epitel paru manusia yang terinfeksi secara utuh, tim mengidentifikasi ratusan pasangan protein virus-inang dan menggabungkan pengukuran tersebut dengan pemodelan struktural berbasis AlphaFold untuk menyimpulkan di mana protein-protein tersebut saling bersentuhan.
Di antara temuan tersebut, studi ini mengaitkan infeksi influenza A dengan gangguan pada paraspeckle—struktur tanpa membran dalam nukleus sel yang dibangun di sekitar RNA non-coding panjang NEAT1. Para penulis melaporkan bahwa protein virus berinteraksi dengan komponen paraspeckle dan bahwa endonuklease virus, PA-X, berkontribusi pada gangguan paraspeckle dengan mendegradasi NEAT1, suatu perubahan yang melepaskan faktor inang yang menurut studi tersebut dapat memfasilitasi replikasi influenza A.
“Melihat organel kecil di dalam nukleus ini meluruh, secara konsisten di setiap lini sel dan setiap galur flu yang kami uji, memberi tahu kami bahwa ini bukanlah efek samping dari infeksi – ini mungkin sebuah strategi,” ujar penulis pertama Iuliia Kotova dalam sebuah pernyataan yang menyertai karya tersebut.
Hasil penelitian ini diterbitkan dalam Nature Microbiology. Para peneliti mengatakan peta interaksi tersebut dapat membantu memandu studi masa depan mengenai biologi influenza, termasuk pekerjaan yang relevan dengan galur yang menjadi perhatian seperti H5N1.
