Investigadores presentan un mapa de interacción a nivel de residuos dentro de las células entre las proteínas de la influenza A y las proteínas humanas, describiendo cómo la infección puede alterar las paraspeckles nucleares y liberar potencialmente factores del huésped que favorecen la replicación viral.
Investigadores con sede en el EMBL de Hamburgo, en colaboración con el Instituto Leibniz de Farmacología Molecular (FMP), han reportado un mapa de alta resolución de los contactos entre las proteínas del virus de la influenza A y las proteínas humanas dentro de las células infectadas.
Utilizando espectrometría de masas con entrecruzamiento in-cell en células epiteliales pulmonares humanas intactas, el equipo identificó cientos de pares de proteínas virus-huésped y combinó esas mediciones con modelos estructurales basados en AlphaFold para inferir dónde entran en contacto las proteínas entre sí.
Entre los hallazgos, el estudio vincula la infección por influenza A con la interrupción de las paraspeckles, estructuras sin membrana en el núcleo celular construidas alrededor del ARN largo no codificante NEAT1. Los autores informan que las proteínas virales interactúan con los componentes de las paraspeckles y que una endonucleasa viral, PA-X, contribuye a la alteración de las paraspeckles al degradar el NEAT1, un cambio que libera factores del huésped que, según el estudio, pueden facilitar la replicación de la influenza A.
"Observar cómo estos minúsculos orgánulos en el núcleo se disuelven, de manera consistente en cada línea celular y cada cepa de gripe que analizamos, nos indicó que esto no es un efecto secundario de la infección, sino que podría ser una estrategia", afirmó la autora principal Iuliia Kotova en una declaración que acompaña al trabajo.
Los resultados fueron publicados en Nature Microbiology. Los investigadores señalaron que el mapa de interacción podría ayudar a guiar futuros estudios sobre la biología de la influenza, incluido el trabajo relevante para cepas de interés como la H5N1.
