Pesquisadores descrevem um mapa de interação em nível de resíduo dentro das células entre proteínas do influenza A e proteínas humanas, delineando como a infecção pode interromper paraspeckles nucleares e potencialmente liberar fatores do hospedeiro que auxiliam a replicação viral.
Pesquisadores baseados no EMBL Hamburg, em colaboração com o Instituto de Pesquisa Leibniz de Farmacologia Molecular (FMP), reportaram um mapa de alta resolução dos contatos entre proteínas do vírus influenza A e proteínas humanas dentro de células infectadas.
Utilizando espectrometria de massa por cross-linking in-cell em células epiteliais pulmonares humanas infectadas intactas, a equipe identificou centenas de pares de proteínas vírus-hospedeiro e combinou essas medições com modelagem estrutural baseada em AlphaFold para inferir onde as proteínas entram em contato umas com as outras.
Entre as descobertas, o estudo associa a infecção por influenza A à interrupção de paraspeckles—estruturas sem membrana no núcleo celular construídas em torno do RNA longo não codificante NEAT1. Os autores relatam que proteínas virais interagem com componentes dos paraspeckles e que uma endonuclease viral, PA-X, contribui para a interrupção dos paraspeckles ao degradar o NEAT1, uma mudança que libera fatores do hospedeiro que, segundo o estudo, podem facilitar a replicação do influenza A.
"Observar essas pequenas organelas no núcleo se dissolvendo, consistentemente em todas as linhagens celulares e em todas as cepas de gripe que testamos, nos disse que isso não é um efeito colateral da infecção – pode ser uma estratégia", afirmou a primeira autora Iuliia Kotova em um comunicado que acompanha o trabalho.
Os resultados foram publicados na Nature Microbiology. Os pesquisadores afirmaram que o mapa de interação pode ajudar a orientar futuros estudos sobre a biologia do influenza, incluindo trabalhos relevantes para cepas de preocupação, como o H5N1.