Des chercheurs ont établi une carte d'interaction cellule par cellule, au niveau des résidus, entre les protéines du virus de la grippe A et les protéines humaines, illustrant la manière dont l'infection peut perturber les paraspeckles nucléaires et potentiellement libérer des facteurs de l'hôte favorisant la réplication virale.
Des chercheurs basés à l'EMBL de Hambourg, en collaboration avec l'Institut Leibniz de pharmacologie moléculaire (FMP), ont publié une carte haute résolution des contacts entre les protéines du virus de la grippe A et les protéines humaines à l'intérieur de cellules infectées.
En utilisant la spectrométrie de masse par réticulation in situ sur des cellules épithéliales pulmonaires humaines intactes et infectées, l'équipe a identifié des centaines de paires de protéines virus-hôte et a combiné ces mesures avec une modélisation structurelle basée sur AlphaFold pour déduire les points de contact entre les protéines.
Parmi les résultats, l'étude associe l'infection par la grippe A à la perturbation des paraspeckles, des structures sans membrane présentes dans le noyau cellulaire, construites autour de l'ARN long non codant NEAT1. Les auteurs rapportent que les protéines virales interagissent avec les composants des paraspeckles et qu'une endonucléase virale, PA-X, contribue à la désorganisation de ces derniers en dégradant le NEAT1, un changement qui libère des facteurs de l'hôte pouvant, selon l'étude, faciliter la réplication du virus de la grippe A.
« Observer ces minuscules organites du noyau se dissoudre, de manière cohérente dans toutes les lignées cellulaires et toutes les souches grippales testées, nous a indiqué qu'il ne s'agit pas d'un effet secondaire de l'infection, mais potentiellement d'une stratégie », a déclaré l'auteure principale Iuliia Kotova dans un communiqué accompagnant les travaux.
Les résultats ont été publiés dans Nature Microbiology. Les chercheurs ont indiqué que la carte d'interaction pourrait aider à orienter les futures études sur la biologie de la grippe, y compris les travaux pertinents pour les souches préoccupantes telles que H5N1.
