Para ilmuwan telah memperkirakan seberapa cepat strain E. coli tertentu menyebar antar manusia dan menemukan satu garis keturunan dengan angka reproduksi dasar yang sebanding dengan flu babi H1N1. Menggunakan data genomik dari Inggris dan Norwegia, analisis—diterbitkan 4 November 2025 di Nature Communications—memodelkan transmisi untuk tiga klad ST131 dan menekankan implikasi untuk melacak infeksi resisten antibiotik.
Penelitian baru melaporkan bahwa klon E. coli terkait manusia dapat menyebar antar orang dengan kecepatan sebanding dengan flu babi H1N1 tahun 2009, berdasarkan estimasi pertama dari jenisnya untuk angka reproduksi dasar (R0) bagi bakteri kolonisasi usus. Studi tersebut, diterbitkan 4 November 2025, berfokus pada tiga klad dari garis keturunan ST131 yang tersebar secara global: ST131-A, ST131-C1, dan ST131-C2. (dx.doi.org)
Secara kuantitatif, penulis memperkirakan nilai R0 sebesar 1,47 untuk ST131-A, 1,18 untuk ST131-C1, dan 1,13 untuk ST131-C2—menunjukkan potensi transmisi yang jauh lebih tinggi untuk ST131-A. (dx.doi.org)
Untuk menyimpulkan nilai-nilai ini, tim menggabungkan data kolonisasi dari UK Baby Biome Study dengan pengawasan genomik infeksi darah E. coli di Inggris dan Norwegia. Semua penjujukan dilakukan di Wellcome Sanger Institute, dan model dibangun menggunakan ELFI (Engine for Likelihood-Free Inference). (sanger.ac.uk)
E. coli biasanya tinggal tanpa bahaya di usus dan tidak ditularkan melalui tetesan udara; penyebaran dapat terjadi melalui kontak dekat (misalnya, berciuman) atau secara tidak langsung melalui permukaan bersama, makanan, atau rumah tangga. (sciencedaily.com)
Studi menemukan bahwa ST131-A menyebar secepat virus di balik wabah besar, termasuk H1N1. Sebaliknya, ST131-C1 dan ST131-C2 menyebar lebih lambat di antara orang sehat tetapi kemungkinan menular lebih cepat di rumah sakit dan pengaturan perawatan kesehatan lainnya. Kedua klad ini resisten terhadap kelas antibiotik ganda dan termasuk penyebab paling umum infeksi saluran kemih dan darah di Inggris, dan termasuk yang paling umum di Norwegia. (sanger.ac.uk)
Menambahkan konteks tentang beban resistensi, data UK Health Security Agency menunjukkan bahwa di Inggris pada 2021 lebih dari dua per lima infeksi darah E. coli resisten terhadap co-amoxiclav, antibiotik kunci rumah sakit. (gov.uk)
“Ini adalah yang pertama untuk bakteri apa pun yang hidup di mikrobioma usus kita,” kata penulis pertama bersama Fanni Ojala dari Universitas Aalto, merujuk pada estimasi R0 untuk bakteri kolonisasi usus. (sanger.ac.uk)
“Memiliki R0 untuk E. coli memungkinkan kita membandingkan penyebaran antar infeksi,” tambah penulis senior Jukka Corander dari Wellcome Sanger Institute dan Universitas Oslo, mencatat kebutuhan untuk menyelidiki pendorong genetik transmisi. (sciencedaily.com)
Penulis mengatakan kerangka kerja tersebut dapat memandu pemantauan bertarget untuk mencegah wabah dan membantu mengurangi ketergantungan pada antibiotik spektrum luas. Mereka menambahkan bahwa pendekatan tersebut dapat disesuaikan dengan patogen bakteri lainnya. (sanger.ac.uk)
