Les scientifiques ont estimé la rapidité avec laquelle certaines souches d'E. coli se propagent entre les personnes et ont trouvé une lignée avec un nombre de reproduction de base comparable à celui de la grippe porcine H1N1. S'appuyant sur des données génomiques du Royaume-Uni et de Norvège, l'analyse —publiée le 4 novembre 2025 dans Nature Communications— modélise la transmission pour trois clades ST131 et souligne les implications pour le suivi des infections résistantes aux antibiotiques.
Une nouvelle recherche rapporte qu'un clone d'E. coli associé à l'humain peut se propager entre les personnes à un rythme comparable à celui de la grippe porcine H1N1 de 2009, basé sur des estimations inédites du nombre de reproduction de base (R0) pour les bactéries colonisatrices de l'intestin. L'étude, publiée le 4 novembre 2025, se concentre sur trois clades de la lignée ST131 distribuée mondialement : ST131-A, ST131-C1 et ST131-C2. (dx.doi.org)
Quantitativement, les auteurs estiment des valeurs de R0 de 1,47 pour ST131-A, 1,18 pour ST131-C1 et 1,13 pour ST131-C2 —indiquant un potentiel de transmission nettement plus élevé pour ST131-A. (dx.doi.org)
Pour inférer ces valeurs, l'équipe a combiné des données de colonisation de l'étude UK Baby Biome avec la surveillance génomique des infections sanguines à E. coli au Royaume-Uni et en Norvège. Tout le séquençage a été réalisé à l'Institut Wellcome Sanger, et le modèle a été construit en utilisant ELFI (Engine for Likelihood-Free Inference). (sanger.ac.uk)
E. coli réside généralement sans danger dans l'intestin et n'est pas transmise par des gouttelettes aériennes ; la propagation peut se produire par contact étroit (par exemple, les baisers) ou indirectement via des surfaces partagées, des aliments ou des ménages. (sciencedaily.com)
L'étude trouve que ST131-A se propage aussi rapidement que les virus derrière les grandes épidémies, y compris H1N1. En revanche, ST131-C1 et ST131-C2 se propagent plus lentement chez les personnes en bonne santé mais sont susceptibles de se transmettre plus rapidement dans les hôpitaux et d'autres établissements de santé. Ces deux clades sont résistants à plusieurs classes d'antibiotiques et figurent parmi les causes les plus courantes d'infections urinaires et sanguines au Royaume-Uni, et sont courants en Norvège. (sanger.ac.uk)
Ajoutant un contexte sur les charges de résistance, les données de l'UK Health Security Agency montrent qu'en Angleterre en 2021, plus de deux cinquièmes des infections sanguines à E. coli étaient résistantes au co-amoxiclav, un antibiotique clé hospitalier. (gov.uk)
« C'était une première pour toute bactérie vivant dans notre microbiote intestinal », a déclaré la co-auteure principale Fanni Ojala de l'Université Aalto, en référence à l'estimation d'un R0 pour les bactéries colonisatrices de l'intestin. (sanger.ac.uk)
« Avoir le R0 pour E. coli nous permet de comparer la propagation entre les infections », a ajouté l'auteur principal Jukka Corander de l'Institut Wellcome Sanger et de l'Université d'Oslo, notant la nécessité d'explorer les facteurs génétiques de la transmission. (sciencedaily.com)
Les auteurs disent que le cadre pourrait guider une surveillance ciblée pour prévenir les épidémies et aider à réduire la dépendance aux antibiotiques à large spectre. Ils ajoutent que l'approche pourrait être adaptée à d'autres pathogènes bactériens. (sanger.ac.uk)
