Alors que les antibiotiques échouent de plus en plus, les chercheurs de l'AIIMS Delhi mènent la bataille contre les superbactéries grâce à un diagnostic précoce, des recherches sur les biomarqueurs et un usage rationnel des antibiotiques. Un cas récent d'un homme de 50 ans atteint d'une méningite bactérienne résistante souligne l'urgence. L'institut mène plusieurs projets pour ralentir la résistance antimicrobienne.
Un homme de 50 ans est arrivé à l'All India Institute of Medical Sciences (AIIMS) de Delhi avec de la fièvre, des maux de tête, une raideur de la nuque et de la confusion. Les médecins ont suspecté une méningite et ont testé si elle était virale ou bactérienne. Les résultats de laboratoire ont confirmé une infection bactérienne, mais la bactérie était résistante à la pénicilline. «Ce qui nous a surpris, c'est que ce patient n'avait jamais été hospitalisé auparavant», déclare le Dr Bimal Kumar Das, professeur et chef du département de microbiologie à l'AIIMS Delhi. La résistance antimicrobienne (RAM), où les micro-organismes évoluent pour survivre aux médicaments, représente une menace sérieuse pour la santé publique. Elle devrait causer 10 millions de décès dans le monde d'ici 2050. En Inde, environ 297 000 décès ont été liés à la RAM en 2019, et le pays reste l'un des plus grands consommateurs d'antibiotiques. La lutte contre la RAM est une priorité à l'AIIMS, qui mène une quinzaine de projets de recherche axés sur la compréhension des schémas de résistance, l'amélioration du diagnostic et la promotion d'un usage rationnel des antibiotiques. L'institut a été désigné comme centre de laboratoire de diagnostic de recherche sur les maladies infectieuses (IRDL) et sert de centre de coordination nodal pour le réseau de surveillance de la résistance antimicrobienne (AMRSN). «L'accent est mis sur le diagnostic précoce, la thérapie ciblée et un contrôle rigoureux des infections nosocomiales», dit le Dr Das. La résistance croissante de Salmonella typhi, qui cause la typhoïde, est une préoccupation majeure dans le nord de l'Inde, étudiée à l'aide de tests génétiques avancés. Un moteur principal de la RAM est l'usage empirique d'antibiotiques, commencé avant l'identification du pathogène, surtout chez les patients critiques. «Nous commençons une thérapie empirique basée sur la cause la plus probable. Mais si nous ne pouvons pas identifier l'organisme plus tard, les antibiotiques continuent plus longtemps que nécessaire», dit le Dr Hitender Gautam, professeur de microbiologie à l'AIIMS Delhi. Un domaine clé est la septicémie, une réponse potentiellement mortelle à l'infection pouvant mener à une défaillance d'organes. L'équipe du Dr Gautam identifie des biomarqueurs spécifiques au site pour la bactériémie, où les bactéries entrent dans le sang. Pour la méningite bactérienne, la recherche cible les bactéries viables mais non cultivables (VBNC) pour éviter les antibiotiques inutiles. De nouvelles signatures ADN et ARN sont développées pour détecter la résistance chez les pathogènes ESKAPE comme Klebsiella pneumoniae. Les infections urinaires (IU) deviennent de plus en plus résistantes en raison d'un usage abusif, y compris le traitement de la bactériurie asymptomatique. L'AIIMS explore une thérapie d'édition génique basée sur CRISPR-Cas9 pour cibler E. coli résistante. Des données spécifiques à l'Inde sont générées sur de nouveaux antibiotiques comme l'éravacycline et l'omadacycline. Les inhibiteurs du quorum sensing, comme la furanone et le nitrate de gallium, perturbent la communication bactérienne pour prévenir les biofilms. Pour la tuberculose multirésistante, le régime BPaL-M —combinaison de bédaquiline, prétomanid, linézolide et moxifloxacine— raccourcit le traitement à six mois avec un taux de succès supérieur à 90 %. Le séquençage génomique permet une identification rapide des résistances. «Seule cette approche multifacette du diagnostic précoce, de la thérapie ciblée, de l'innovation et d'un contrôle strict des infections peut ralentir l'essor des superbactéries en Inde», insistent les experts.
