Une analyse génomique d'Escherichia coli isolée d'ulcères diabétiques infectés au pied dans 10 pays n'a trouvé aucune souche dominante unique, révélant au lieu de cela une grande diversité génétique et un sous-ensemble d'isolats avec des marqueurs de résistance multidrogue ou de résistance étendue aux médicaments, rapportent des chercheurs du King’s College London et de l'University of Westminster.
Les infections du pied diabétique sont une complication grave du diabète et une cause principale d'amputation des membres inférieurs dans le monde entier, souvent difficiles à gérer lorsque les plaies impliquent de multiples microbes et une résistance aux antibiotiques. Une nouvelle recherche menée par le King’s College London, en collaboration avec l'University of Westminster, apporte des détails sur un organisme fréquemment détecté dans ces infections : Escherichia coli. L'étude, publiée dans Microbiology Spectrum, a analysé les séquences de génome complet de 42 souches de E. coli isolées d'ulcères diabétiques infectés au pied chez des patients de 10 pays — Nigeria, Royaume-Uni, Ghana, Suède, Malaisie, Chine, Corée du Sud, Brésil, Inde et États-Unis. Les données génomiques ont montré que les isolats appartenaient à de nombreux groupes génétiques différents et portaient un large mélange de gènes associés à la virulence et à la résistance antimicrobienne. Les résultats indiquent qu'il n'existe pas une seule souche « pied diabétique » de E. coli responsable de ces infections ; plutôt, plusieurs lignées non apparentées semblent capables de s'adapter à l'environnement du pied diabétique. Les chercheurs ont également rapporté que environ 8 % des souches étaient classées comme multirésistantes ou extensivement résistantes aux médicaments, une découverte qui pourrait compliquer le traitement en limitant les options d'antibiotiques efficaces. « Comprendre ces bactéries au niveau génomique est une étape cruciale vers l'amélioration du diagnostic et la mise en œuvre de traitements plus ciblés pour les personnes diabétiques », a déclaré le Dr Vincenzo Torraca, chargé de cours en maladies infectieuses au King’s College London et auteur principal de l'article. Il a ajouté que l'identification des souches présentes et des antibiotiques qu'elles sont susceptibles de résister pourrait aider les cliniciens à choisir des thérapies plus susceptibles de fonctionner, réduisant potentiellement les infections prolongées, les hospitalisations et le risque d'amputation. Victor Ajumobi, premier auteur de l'étude et doctorant au King’s College London et à l'University of Westminster, a déclaré que ces résultats pourraient être particulièrement utiles dans les contextes à faibles ressources, où les infections à E. coli des ulcères diabétiques au pied sont rapportées comme plus fréquentes et où les outils rapides pour détecter la résistance antimicrobienne peuvent être limités. L'équipe a indiqué que les travaux futurs se concentreront sur la manière dont des facteurs de virulence spécifiques identifiés dans les génomes — tels que des gènes liés à l'adhésion tissulaire ou à l'évasion immunitaire — contribuent à la progression de la maladie, dans le but d'identifier des cibles thérapeutiques potentielles. L'étude est intitulée « Structure de population, résistance antimicrobienne et facteurs de virulence de Escherichia coli associé au pied diabétique » et paraît dans Microbiology Spectrum (DOI : 10.1128/spectrum.02837-25).
