Une nouvelle étude sur des milliers de rats suggère que les gènes des partenaires sociaux peuvent façonner le microbiote intestinal d’un individu via des microbes partagés. Les chercheurs ont trouvé des influences génétiques plus fortes en tenant compte de ces effets sociaux. Les résultats mettent en lumière des voies indirectes par lesquelles la génétique affecte la santé via l’échange microbien.
Publié le 18 décembre dans Nature Communications, l’étude a examiné plus de 4 000 rats génétiquement uniques de quatre cohortes logés dans différentes installations aux États-Unis. Ces conditions contrôlées ont permis aux scientifiques d’isoler les impacts génétiques sur le microbiote intestinal, composé de trillions de micro-organismes aidant à la digestion et à la santé.
L’équipe, du Centre for Genomic Regulation à Barcelone et de l’Université de Californie à San Diego, a identifié trois régions génétiques systématiquement liées à des bactéries spécifiques dans tous les environnements. Le gène St6galnac1, qui modifie le mucus intestinal avec des sucres, était corrélé à des niveaux plus élevés de bactéries Paraprevotella. Les gènes mucine, formant la couche protectrice de l’intestin, étaient associés aux bactéries Firmicutes, tandis que le gène Pip, produisant des molécules antibactériennes, était lié aux membres de la famille Muribaculaceae.
En modélisant les effets génétiques indirects — où les gènes d’un rat influencent ses compagnons de cage via le partage de microbes —, l’étude a révélé que les facteurs sociaux amplifiaient les influences génétiques de quatre à huit fois pour ces liens. « Ce n’est pas de la magie, mais le résultat d’influences génétiques qui débordent sur les autres par le contact social. Les gènes façonnent le microbiote intestinal et nous avons découvert que ce ne sont pas seulement nos propres gènes qui comptent », a déclaré l’auteure principale, Dr Amelie Baud.
Les résultats suggèrent que les gènes peuvent modifier indirectement la biologie d’autrui sans transfert d’ADN. Chez l’humain, des mécanismes similaires pourraient sous-estimer les rôles génétiques dans des problèmes de santé comme la fonction immunitaire ou le métabolisme. Le St6galnac1 du rat est lié au ST6GAL1 humain, précédemment associé à Paraprevotella et à des conditions telles que la susceptibilité au COVID-19 ou la néphropathie par IgA. La Dr Baud a noté : « Nous n’avons probablement découvert que la pointe de l’iceberg. »
Les travaux futurs approfondiront ces interactions microbe-gène, clarifiant potentiellement les liens avec la santé.
