Analisis genomik Escherichia coli yang diisolasi dari ulkus kaki diabetes yang terinfeksi di 10 negara tidak menemukan strain dominan tunggal, melainkan mengungkap keragaman genetik yang luas dan subkelompok isolat dengan penanda resistensi obat multi atau resistensi obat ekstensif, lapor peneliti dari King’s College London dan University of Westminster.
Infeksi kaki diabetes merupakan komplikasi serius dari diabetes dan merupakan penyebab utama amputasi anggota bawah di seluruh dunia, sering kali sulit dikelola ketika luka melibatkan berbagai mikroba dan resistensi terhadap antibiotik. Penelitian baru yang dipimpin oleh King’s College London, bekerja sama dengan University of Westminster, menambahkan detail tentang satu organisme yang sering terdeteksi dalam infeksi ini: Escherichia coli. Studi yang diterbitkan di Microbiology Spectrum menganalisis urutan genom utuh dari 42 strain E. coli yang diisolasi dari ulkus kaki diabetes yang terinfeksi pada pasien dari 10 negara—Nigeria, Inggris, Ghana, Swedia, Malaysia, China, Korea Selatan, Brasil, India, dan Amerika Serikat. Data genomik menunjukkan bahwa isolat-isolat tersebut termasuk dalam banyak kelompok genetik yang berbeda dan membawa campuran luas gen yang terkait dengan virulensi dan resistensi antimikroba. Hasilnya menunjukkan bahwa tidak ada strain E. coli tunggal “kaki diabetes” yang bertanggung jawab atas infeksi ini; sebaliknya, berbagai garis keturunan yang tidak berhubungan tampak mampu beradaptasi dengan lingkungan kaki diabetes. Peneliti juga melaporkan bahwa sekitar 8% strain diklasifikasikan sebagai multiresisten obat atau ekstensif resistan obat, temuan yang dapat mempersulit pengobatan dengan membatasi pilihan antibiotik yang efektif. “Memahami bakteri ini pada tingkat genomik adalah langkah krusial menuju perbaikan diagnosis dan memungkinkan pengobatan yang lebih tertarget bagi penderita diabetes,” kata Dr. Vincenzo Torraca, Dosen Penyakit Menular di King’s College London dan penulis senior makalah. Ia menambahkan bahwa mengidentifikasi strain mana yang ada dan antibiotik mana yang kemungkinan besar ditolak dapat membantu klinisi memilih terapi yang lebih mungkin berhasil, berpotensi mengurangi infeksi berkepanjangan, rawat inap, dan risiko amputasi. Victor Ajumobi, penulis pertama studi dan mahasiswa PhD di King’s College London dan University of Westminster, mengatakan temuan ini bisa sangat berguna di pengaturan sumber daya rendah, di mana infeksi E. coli ulkus kaki diabetes dilaporkan lebih umum dan alat cepat untuk mendeteksi resistensi antimikroba mungkin terbatas. Tim mengatakan pekerjaan mendatang akan fokus pada bagaimana faktor virulensi spesifik yang diidentifikasi dalam genom—seperti gen yang terkait dengan keterikatan jaringan atau penghindaran imun—berkontribusi pada perkembangan penyakit, dengan tujuan mengidentifikasi target terapeutik potensial. Studi berjudul “Struktur populasi, resistensi antimikroba, dan faktor virulensi Escherichia coli terkait kaki diabetes” dan muncul di Microbiology Spectrum (DOI: 10.1128/spectrum.02837-25).
