Skor risiko genetik dapat mengungkap informasi DNA tersembunyi

Para peneliti menemukan bahwa skor risiko poligenik, yang merangkum kemungkinan seseorang mengembangkan penyakit seperti diabetes dan kanker, dapat direkayasa balik untuk mengungkap data genetik mendasar. Kerentanan ini menimbulkan kekhawatiran privasi, yang berpotensi memungkinkan identifikasi melalui basis data publik atau rekonstruksi oleh perusahaan asuransi. Penemuan ini menyoroti risiko dalam berbagi skor tersebut, bahkan secara anonim.

Skor risiko poligenik (PRS) merangkum efek dari berbagai polimorfisme nukleotida tunggal (SNP) dalam genom untuk memperkirakan predisposisi penyakit. Perusahaan seperti 23andMe dan para peneliti menggunakan skor ini untuk menguraikan risiko kesehatan, dan individu terkadang membagikannya secara publik untuk mendapatkan saran interpretasi. Skor ini secara tradisional dianggap berisiko rendah bagi privasi karena kompleksitas komputasi masalah ransel—mirip dengan mendeduksi nomor telepon dari jumlah digitnya—namun kini terbukti dapat dieksploitasi. Kuncinya terletak pada bobot presisi hingga 16 digit yang diberikan pada kontribusi setiap SNP terhadap risiko penyakit, terutama pada model yang lebih kecil. Gamze Gürsoy di Universitas Columbia di New York menjelaskan: “Karena skor risiko poligenik akhir dibatasi oleh jumlah cara terbatas untuk mencapai angka tersebut, dan susunan SNP mendasar yang secara statistik mungkin, skor tersebut dapat disimpulkan dengan tingkat akurasi yang tinggi.” Bersama Kirill Nikitin, Gürsoy menguji 298 model PRS yang menggunakan 50 atau lebih sedikit SNP pada data genetik dari 2353 individu. Dengan menghitung kemungkinan genom dan menyaring mutasi yang tidak mungkin, mereka melakukan serangan berantai lintas model, mencapai akurasi 94,6 persen dalam merekonstruksi genotipe dan memprediksi 2450 SNP per orang. Secara khusus, hanya 27 SNP sudah cukup untuk mengidentifikasi seseorang dalam basis data 500.000 sampel, dengan presisi hingga 90 persen untuk kerabat. Individu keturunan Afrika dan Asia Timur menghadapi risiko identifikasi lebih tinggi karena kurangnya representasi di basis data genetik. Gürsoy mencatat bahwa 447 model kecil berpresisi tinggi di basis data publik rentan. “Kami ingin menunjukkan bahwa risikonya rendah, tetapi dalam [kondisi tertentu], masih ada kemungkinan kebocoran,” kata Gürsoy, mendorong kehati-hatian dalam desain penelitian yang melibatkan kelompok rentan. Ying Wang di Massachusetts General Hospital mengakui perlindungan data yang ada dan batasan komputasi tetapi merekomendasikan untuk memperlakukan model kecil sebagai sensitif dalam konteks klinis dan proses persetujuan. Temuan ini berasal dari preprint di bioRxiv (DOI: 10.64898/2026.02.16.706191).

Artikel Terkait

Researchers at Northwestern Medicine developing an integrated genomic risk score to predict heart rhythm risks, shown working in a lab with genetic data and heart monitors.
Gambar dihasilkan oleh AI

Northwestern Medicine mengembangkan tes genetik untuk risiko gangguan irama jantung

Dilaporkan oleh AI Gambar dihasilkan oleh AI Fakta terverifikasi

Peneliti di Northwestern Medicine menciptakan skor risiko genomik terintegrasi yang bertujuan memprediksi gangguan irama jantung berbahaya secara dini dengan menggabungkan data varian langka, poligenik, dan seluruh genom. Studi yang ditinjau sejawat di Cell Reports Medicine menganalisis 1.119 orang.

Buku baru karya bioetikawan Daphne O. Martschenko dan sosiolog Sam Trejo mengeksplorasi implikasi skor poligenik dalam pengujian genetik, menyoroti ketidaksetaraan potensial dan mitos seputar genetika. Melalui 'kolaborasi adversarial' mereka, penulis berdebat apakah penelitian semacam itu dapat mempromosikan kesetaraan atau memperkuat perpecahan sosial. Mereka menyerukan regulasi yang lebih ketat untuk memastikan penggunaan yang bertanggung jawab.

Dilaporkan oleh AI Fakta terverifikasi

Para peneliti telah mengembangkan teknik pemetaan genomik yang mengungkap bagaimana ribuan gen bekerja sama untuk memengaruhi risiko penyakit, membantu menjembatani kesenjangan yang ditinggalkan oleh studi genetik tradisional. Pendekatan ini, yang dijelaskan dalam makalah Nature yang dipimpin oleh ilmuwan dari Gladstone Institutes dan Universitas Stanford, menggabungkan eksperimen sel skala besar dengan data genetik populasi untuk menyoroti target menjanjikan untuk terapi masa depan dan memperdalam pemahaman tentang kondisi seperti gangguan darah dan penyakit yang dimediasi imun.

Sebuah studi baru menemukan bahwa orang di atas 80 tahun yang mempertahankan kemampuan mental tajam, yang dikenal sebagai super agers, membawa lebih sedikit salinan gen risiko Alzheimer utama dan lebih banyak varian pelindung. Profil genetik ini membedakan mereka bahkan dari senior sehat lainnya di kelompok usia yang sama. Penelitian yang dipimpin oleh Vanderbilt University Medical Center ini menyoroti faktor ketahanan potensial terhadap demensia.

Dilaporkan oleh AI

An experiment in the DARPA-funded SCORE megaproyecto gave the same data to 457 analysts to reanalyze 100 published studies, revealing that only 34% reproduced the original statistical result precisely.

Peneliti Stanford Medicine dan kolaborator melaporkan bahwa model kecerdasan buatan bernama SleepFM dapat menganalisis studi polisomnografi satu malam dan memperkirakan risiko masa depan seseorang untuk lebih dari 100 kondisi medis, termasuk demensia, penyakit jantung, dan beberapa kanker. Tim mengatakan sistem tersebut mempelajari pola di berbagai sinyal fisiologis yang direkam selama tidur dan dapat mengungkap tanda peringatan dini bertahun-tahun sebelum diagnosis klinis.

Dilaporkan oleh AI

Sebuah studi besar mengungkapkan bahwa sekitar satu dari sepuluh orang membawa varian genetik yang membuat mereka lebih rentan terhadap efek parah dari virus Epstein-Barr, yang menginfeksi lebih dari 90 persen populasi. Varian ini terkait dengan persistensi virus yang lebih tinggi dan risiko peningkatan penyakit autoimun seperti multiple sclerosis dan lupus. Temuan, berdasarkan lebih dari 735.000 genom, menyarankan jalur untuk pengobatan dan vaksin yang ditargetkan.

 

 

 

Situs web ini menggunakan cookie

Kami menggunakan cookie untuk analisis guna meningkatkan situs kami. Baca kebijakan privasi kami untuk informasi lebih lanjut.
Tolak