Bungie a publié sa plus importante mise à jour pour Marathon, qui en est à sa deuxième semaine, en introduisant une nouvelle carte de fin de partie appelée Cryo Archive. La mise à jour comprend de nombreux correctifs et ajustements destinés à améliorer le gameplay. Pour accéder à la carte, il faut résoudre des énigmes et remplir des conditions spécifiques.
Marathon est entré dans sa deuxième semaine avec le déploiement par Bungie de la plus importante mise à jour du jeu à ce jour, la version 1.0.5. La principale nouveauté est Cryo Archive, une nouvelle carte de fin de partie qui est en ligne mais difficilement accessible. Les notes de patch de Bungie indiquent "Bonne chance pour y arriver", ce qui laisse présager un défi similaire aux énigmes de l'ARG de Destiny. Les joueurs ont déjà résolu des énigmes et découvert des vidéos au cours de la semaine écoulée, et d'autres phases devraient bientôt se déclencher automatiquement pour la plupart des utilisateurs. Pour entrer dans Cryo Archive, les coureurs doivent atteindre le niveau 25 et débloquer l'accès à toutes les factions, un processus qui demande du temps et des efforts, ce qui risque d'exclure les joueurs occasionnels dans un premier temps. Parallèlement, Bungie a résolu plusieurs problèmes liés au jeu de base. Le fusil de combat WSTR dominant a reçu un nerf pour son efficacité dans les espaces restreints. Un bug provoquant le déséquipement des cosmétiques de couteau a été corrigé, et les vaisseaux de largage UESC ne traversent plus les cartes et ne blessent plus les joueurs à leur arrivée. La gestion de l'inventaire a été améliorée grâce à la fonctionnalité de glisser-déposer pour les mods d'armes. Des améliorations audio ont permis de réduire le rayon de détection des tirs ennemis, corrigeant ainsi un récent réglage excessif qui permettait d'entendre des sons provenant de l'autre côté de la carte. D'autres améliorations ont permis d'augmenter les chutes de munitions et la fréquence des rencontres avec les joueurs afin de réduire les temps d'arrêt. Bungie a également introduit un mode duo expérimental, en réponse aux demandes des fans, bien que certains s'inquiètent de la fragmentation du matchmaking. Les notes de patch complètes sont disponibles séparément.
