Des scientifiques ont mis au point une nouvelle méthode utilisant des éléments transposables pour retracer l'histoire évolutive de génomes végétaux complexes. Cette approche a été testée sur le fraisier cultivé et a permis d'identifier plusieurs événements d'hybridation anciens qui ont façonné son génome octoploïde.
Des chercheurs du département de l'Agriculture des États-Unis et d'institutions partenaires ont appliqué cette technique à Fragaria × ananassa. Ils ont identifié quatre sous-génomes distincts et ont daté trois événements successifs d'allopolyploïdisation à environ 3,1-4,2 millions d'années, 1,9-3,1 millions d'années et 0,8-1,9 million d'années.
Les conclusions confirment des liens étroits entre deux sous-génomes et les espèces Fragaria vesca et Fragaria iinumae. Elles remettent également en question les modèles précédents qui suggéraient l'existence de progéniteurs diploïdes supplémentaires et indiquent que certains contributeurs pourraient être éteints ou non échantillonnés.
Un auteur principal a noté que la méthode traite les éléments transposables comme des marqueurs temporels évolutifs. Cela permet de reconstruire l'histoire du génome sans avoir recours à des références ancestrales connues.
L'étude a été publiée dans Horticulture Research et financée par une subvention du National Institute of Food and Agriculture. Elle offre un outil pour l'analyse d'autres cultures polyploïdes telles que le blé et le coton.
