Une analyse génétique à grande échelle a identifié un troisième groupe ancestral jusqu'alors négligé au Japon, remettant en cause la théorie longtemps admise d'une double origine. Les chercheurs ont relié cette nouvelle ascendance à l'ancien peuple Emishi du nord-est du Japon. Les résultats établissent également un lien entre l'ADN archaïque des Néandertaliens et des Dénisoviens et des problèmes de santé modernes.
Des scientifiques du Centre des sciences médicales intégratives du RIKEN ont séquencé les génomes complets de plus de 3 200 personnes réparties dans sept régions, de Hokkaido à Okinawa. L'étude, publiée dans Science Advances, a révélé que la population japonaise descend de trois sources ancestrales majeures plutôt que deux. L'ascendance des chasseurs-cueilleurs Jomon atteint 28,5 % à Okinawa mais seulement 13,4 % dans l'ouest du Japon, tandis que la composante nouvellement identifiée liée aux Emishi se concentre dans le nord-est.