Peneliti ciptakan evolusi berpemandu cahaya untuk protein dinamis

Para ilmuwan di EPFL telah mengembangkan teknik bernama optovolution, menggunakan cahaya untuk mengembangkan protein yang beralih keadaan, merasakan lingkungan, dan melakukan komputasi. Dengan merekayasa sel ragi agar hanya bertahan hidup jika protein berperilaku secara dinamis, metode ini memilih varian optimal dengan cepat. Pendekatan ini, yang diterbitkan di Cell, memajukan biologi sintetik dan optogenetika.

Evolusi di alam membentuk sistem biologis melalui seleksi variasi efektif pada DNA, RNA, dan protein. Manusia telah lama memengaruhi proses ini, dari pemuliaan selektif di pertanian hingga evolusi terarah modern di laboratorium, yang meningkatkan protein seperti enzim dan antibodi untuk kedokteran dan industri. Tradisional evolusi terarah menerapkan tekanan konstan, menguntungkan protein yang aktif sepanjang waktu. Ini mengabaikan kebutuhan dinamis banyak protein, yang bertindak sebagai saklar atau gerbang logika merespons kondisi yang berubah. Metode semacam itu sering merusak kemampuan beralih, mempersulit penciptaan protein multi-keadaan. Untuk mengatasi hal ini, Sahand Jamal Rahi dan rekan-rekannya di Laboratorium Fisika Sistem Biologis EPFL memperkenalkan optovolution. Diterbitkan di Cell pada 9 Maret 2026, studi ini merinci bagaimana cahaya mengarahkan evolusi protein untuk fungsi dinamis. Menggunakan ragi pembelahan tunas Saccharomyces cerevisiae, para peneliti merancang ulang siklus sel sehingga pembelahan bergantung pada kemampuan protein untuk beralih antara keadaan aktif dan tidak aktif. Sebuah pengatur yang terkait dengan protein mengendalikan siklus: esensial pada satu fase tetapi toksik pada fase lain. Protein yang gagal beralih dengan benar akan terhenti atau membunuh sel. Optogenetika menyampaikan pulsa cahaya berwaktu untuk mengganti keadaan, dengan setiap siklus 90 menit menguji kinerja. Protein yang sukses memungkinkan kelangsungan hidup dan reproduksi, mengotomatisasi seleksi tanpa intervensi manual. Optovolution menghasilkan 19 varian faktor transkripsi yang dikendalikan cahaya, menunjukkan sensitivitas cahaya yang ditingkatkan, aktivitas gelap yang lebih rendah, atau respons cahaya hijau—menantang untuk warna yang lebih hangat. Ia juga mengembangkan sistem cahaya merah independen dari kofaktor kimia, melalui mutasi yang menonaktifkan protein transpor ragi untuk memanfaatkan molekul internal. Lebih lanjut, tim menciptakan faktor transkripsi yang bertindak sebagai gerbang logika, mengaktifkan gen hanya dengan sinyal cahaya dan kimia secara simultan. Ini memungkinkan protein merasakan perubahan, membuat keputusan seluler, dan mengendalikan pembelahan, membuka peluang di biologi sintetik, bioteknologi, dan penelitian evolusi. Penyumbang mencakup Laboratorium Rekayasa Protein dan Sel EPFL, Universitas Bayreuth, dan Rumah Sakit Universitas Lausanne. Referensi jurnal adalah Vojislav Gligorovski dkk., 'Light-directed evolution of dynamic, multi-state, and computational protein functionalities,' Cell, 2026, DOI: 10.1016/j.cell.2026.02.002.

Artikel Terkait

Photorealistic depiction of DHX29 protein selectively silencing inefficient mRNA codons in a human cell, illustrating new gene expression research.
Gambar dihasilkan oleh AI

Study identifies DHX29 as a key factor linking codon choice to selective silencing of inefficient genetic messages in human cells

Dilaporkan oleh AI Gambar dihasilkan oleh AI Fakta terverifikasi

Researchers at Kyoto University and RIKEN report that human cells can detect “non-optimal” synonymous codons—alternative three-letter genetic instructions that encode the same amino acid but are translated less efficiently—and selectively suppress the corresponding mRNAs. In experiments described in Science, the team identifies the RNA-binding protein DHX29 as a central component of this codon-dependent control of gene expression.

Researchers at New York University have developed a method to direct the assembly of microscopic particles into crystals using light. This technique, detailed in the journal Chem, allows for real-time control over crystal growth and dissolution. The approach could enable new responsive materials for applications in optics and photonics.

Dilaporkan oleh AI

Researchers at Dongguk University in Seoul have developed a magnetically controlled switch for turning on genes inside cells, as detailed in a recent Cell paper. The technique uses a specific electromagnetic signal to activate genes in mice and human cells. Critics, however, question the plausibility of the results and point to potential flaws in the study.

Researchers have discovered that DNA in newly fertilized eggs forms a structured 3D scaffold before the genome activates, challenging long-held assumptions. Using a new technique called Pico-C, scientists mapped this organization in fruit fly embryos. A related study shows that disrupting this structure in human cells triggers an immune response as if under viral attack.

Dilaporkan oleh AI

Scientists at the University of Basel and ETH Zurich have reversed the polarity of a specialized ferromagnet with a focused laser beam, without heating the material. This achievement, detailed in Nature, combines electron interactions, topology, and dynamical control in a single experiment. The method hints at future light-based electronic circuits on chips.

Scientists have produced the first living synthetic bacterial cells by transplanting a synthetic genome into bacteria whose own genomes were destroyed. The team at the J. Craig Venter Institute calls these revived cells 'zombie cells'. The method addresses challenges in synthetic biology by ensuring control over the new genome.

Dilaporkan oleh AI

Researchers at Rice University have found that the protein PEX11 not only helps peroxisomes divide but also regulates their size during early plant development. In Arabidopsis seedlings, PEX11 mutants developed abnormally large peroxisomes lacking internal vesicles that normally curb growth. The mechanism appears conserved across species, as yeast Pex11 restored normal function in plant mutants.

Situs web ini menggunakan cookie

Kami menggunakan cookie untuk analisis guna meningkatkan situs kami. Baca kebijakan privasi kami untuk informasi lebih lanjut.
Tolak