Peneliti ciptakan evolusi berpemandu cahaya untuk protein dinamis

Para ilmuwan di EPFL telah mengembangkan teknik bernama optovolution, menggunakan cahaya untuk mengembangkan protein yang beralih keadaan, merasakan lingkungan, dan melakukan komputasi. Dengan merekayasa sel ragi agar hanya bertahan hidup jika protein berperilaku secara dinamis, metode ini memilih varian optimal dengan cepat. Pendekatan ini, yang diterbitkan di Cell, memajukan biologi sintetik dan optogenetika.

Evolusi di alam membentuk sistem biologis melalui seleksi variasi efektif pada DNA, RNA, dan protein. Manusia telah lama memengaruhi proses ini, dari pemuliaan selektif di pertanian hingga evolusi terarah modern di laboratorium, yang meningkatkan protein seperti enzim dan antibodi untuk kedokteran dan industri. Tradisional evolusi terarah menerapkan tekanan konstan, menguntungkan protein yang aktif sepanjang waktu. Ini mengabaikan kebutuhan dinamis banyak protein, yang bertindak sebagai saklar atau gerbang logika merespons kondisi yang berubah. Metode semacam itu sering merusak kemampuan beralih, mempersulit penciptaan protein multi-keadaan. Untuk mengatasi hal ini, Sahand Jamal Rahi dan rekan-rekannya di Laboratorium Fisika Sistem Biologis EPFL memperkenalkan optovolution. Diterbitkan di Cell pada 9 Maret 2026, studi ini merinci bagaimana cahaya mengarahkan evolusi protein untuk fungsi dinamis. Menggunakan ragi pembelahan tunas Saccharomyces cerevisiae, para peneliti merancang ulang siklus sel sehingga pembelahan bergantung pada kemampuan protein untuk beralih antara keadaan aktif dan tidak aktif. Sebuah pengatur yang terkait dengan protein mengendalikan siklus: esensial pada satu fase tetapi toksik pada fase lain. Protein yang gagal beralih dengan benar akan terhenti atau membunuh sel. Optogenetika menyampaikan pulsa cahaya berwaktu untuk mengganti keadaan, dengan setiap siklus 90 menit menguji kinerja. Protein yang sukses memungkinkan kelangsungan hidup dan reproduksi, mengotomatisasi seleksi tanpa intervensi manual. Optovolution menghasilkan 19 varian faktor transkripsi yang dikendalikan cahaya, menunjukkan sensitivitas cahaya yang ditingkatkan, aktivitas gelap yang lebih rendah, atau respons cahaya hijau—menantang untuk warna yang lebih hangat. Ia juga mengembangkan sistem cahaya merah independen dari kofaktor kimia, melalui mutasi yang menonaktifkan protein transpor ragi untuk memanfaatkan molekul internal. Lebih lanjut, tim menciptakan faktor transkripsi yang bertindak sebagai gerbang logika, mengaktifkan gen hanya dengan sinyal cahaya dan kimia secara simultan. Ini memungkinkan protein merasakan perubahan, membuat keputusan seluler, dan mengendalikan pembelahan, membuka peluang di biologi sintetik, bioteknologi, dan penelitian evolusi. Penyumbang mencakup Laboratorium Rekayasa Protein dan Sel EPFL, Universitas Bayreuth, dan Rumah Sakit Universitas Lausanne. Referensi jurnal adalah Vojislav Gligorovski dkk., 'Light-directed evolution of dynamic, multi-state, and computational protein functionalities,' Cell, 2026, DOI: 10.1016/j.cell.2026.02.002.

Artikel Terkait

Realistic microscopic view of DNA damage and real-time repair in a living cell using a new fluorescent sensor.
Gambar dihasilkan oleh AI

Ilmuwan mengembangkan sensor sel hidup untuk mengamati perbaikan DNA secara real time

Dilaporkan oleh AI Gambar dihasilkan oleh AI Fakta terverifikasi

Peneliti di Universitas Utrecht telah merancang sensor fluoresen yang memungkinkan ilmuwan mengamati kerusakan dan perbaikan DNA secara real time di dalam sel hidup dan bahkan dalam organisme utuh. Dibangun dari komponen protein seluler alami, alat ini memberikan pandangan kontinu tentang dinamika perbaikan sambil meminimalkan gangguan terhadap mesin sel itu sendiri. Penelitian ini, yang dilaporkan di Nature Communications, dapat membantu penelitian kanker, pengujian obat, dan studi penuaan.

Peneliti di New York University telah mengembangkan metode untuk mengarahkan perakitan partikel mikroskopis menjadi kristal menggunakan cahaya. Teknik ini, yang dirinci dalam jurnal Chem, memungkinkan pengendalian waktu nyata atas pertumbuhan dan pelarutan kristal. Pendekatan ini dapat memungkinkan material responsif baru untuk aplikasi dalam optik dan fotonik.

Dilaporkan oleh AI Fakta terverifikasi

Peneliti di Cold Spring Harbor Laboratory telah mengidentifikasi protein kunci dan kompleks protein yang membantu karsinoma tertentu mengubah identitas seluler mereka dan berpotensi menghindari pengobatan. Dua studi baru, yang berfokus pada kanker pankreas dan kanker paru sel tuft, menyoroti struktur molekuler yang bisa menjadi target untuk terapi yang lebih tepat dan selektif.

Peneliti Penn State melaporkan pertahanan bakteri yang memanfaatkan ulang DNA virus laten: enzim rekombinase bernama PinQ membalikkan segmen genom untuk menghasilkan protein pelindung yang memblokir infeksi, pekerjaan yang dijelaskan dalam Nucleic Acids Research.

Dilaporkan oleh AI Fakta terverifikasi

Para ilmuwan di Scripps Research melaporkan bahwa beberapa kondensat biomolekuler—kompartemen sel seperti tetesan tanpa membran—mengandung jaringan filamen protein tipis yang berfungsi sebagai kerangka internal. Tim mengatakan bahwa mengganggu arsitektur filamen ini mengubah sifat fisik kondensat dan menghambat pertumbuhan bakteri serta segregasi DNA, menimbulkan kemungkinan bahwa struktur kondensat suatu hari bisa menjadi target terapeutik dalam penyakit seperti kanker dan ALS. Studi itu muncul di Nature Structural & Molecular Biology pada 2 Februari 2026.

Para ilmuwan telah mengusulkan model teoretis yang menjelaskan bagaimana sel hidup dapat menghasilkan sinyal listrik mereka sendiri melalui gerakan kecil pada membran mereka. Mekanisme ini, yang didorong oleh proses molekuler aktif, mungkin meniru aktivitas neuron dan memengaruhi transportasi ion. Temuan ini dapat menginformasikan material bio-inspirasi dan memperdalam pemahaman tentang fungsi seluler.

Dilaporkan oleh AI

Peneliti menemukan bahwa DNA pada telur yang baru dibuahi membentuk kerangka 3D terstruktur sebelum genom aktif, menantang asumsi lama. Menggunakan teknik baru bernama Pico-C, para ilmuwan memetakan organisasi ini pada embrio lalat buah. Studi terkait menunjukkan bahwa mengganggu struktur ini pada sel manusia memicu respons imun seolah-olah diserang virus.

 

 

 

Situs web ini menggunakan cookie

Kami menggunakan cookie untuk analisis guna meningkatkan situs kami. Baca kebijakan privasi kami untuk informasi lebih lanjut.
Tolak