Duke-NUS医学校の研究者らがシドニー大学と協力してBrainSTEMを開発した。これは、発達中のヒト脳の2階層シングルセルアトラスで、約68万細胞をプロファイリングする。2025年10月31日にScience Advancesオンラインで公開されたこのリソースは、中脳ドーパミン作動性ニューロンに焦点を当て、ラボ育模型のオフターゲット細胞タイプを特定し、研究コミュニティ向けにオープンにリリースされる。
Duke-NUS医学校の科学者と協力者らがBrainSTEM（Brain Single-cell Two tiEr Mapping）を開発した。これは、ヒト胎児脳の包括的なシングルセルアトラスで、パーキンソン病のモデルをベンチマークし改善することを目的とする。
- 範囲と焦点：アトラスは発達中のヒト脳から約68万細胞をプロファイリングし、パーキンソン病で損なわれるドーパミン作動性ニューロンを特定する高解像度の中脳サブアトラスを含む。
- 重要性：パーキンソン病はシンガポールで2番目に多い神経変性疾患で、50歳以上の1000人に約3人が影響を受ける。より忠実な中脳モデルは研究を強化し、将来の細胞ベース療法を支援する可能性がある。
2025年10月31日にScience Advances（Vol. 11, Issue 44; DOI: 10.1126/sciadv.adu7944）に掲載された研究は、主要なラボ差分化プロトコルが脳の他の領域からの不要な細胞を生み出す可能性があると報告し、実験手法とデータ解析パイプラインの洗練の必要性を強調している。
主任著者と上級研究者がツールの実用的価値を強調した。「私たちのデータ駆動型ブループリントは、科学者がヒト生物学を忠実に反映する高収量の中脳ドーパミン作動性ニューロンを生成するのを助ける。この品質の移植は、細胞療法の有効性を高め、副作用を最小限に抑え、パーキンソン病で生活する人々に代替療法を提供する道を開く上で重要だ」と、Duke-NUSのMD–PhD候補者であるDr. Hilary Tohは述べた。
「シングルセル解像度で脳をマッピングすることで、BrainSTEMは微妙なオフターゲット細胞集団さえ区別する精度を提供する。この豊富な細胞詳細は、患者をグループ化し、神経変性疾患向けの標的療法を設計する方法を変革するAI駆動型モデルの重要な基盤を提供する」と、Duke-NUS計算生物学センターの上級著者であるDr. John Ouyangは述べた。Assistant Professor Alfred Sunは、厳密でデータ駆動型のアプローチが「パーキンソン病のための信頼できる細胞療法の開発を加速する」と付け加え、Duke-NUS研究上級副学部長のProfessor Patrick Tanは、この作業を複雑なシステムで細胞詳細を捉える新しいベンチマークと呼んだ。
チームはアトラスをオープンリソースとしてリリースし、すぐに使えるBrainSTEMパッケージを伴い、研究者が多層マッピングアプローチを任意の脳細胞タイプに適用できるようにする。プロジェクトはシドニー大学の協力者と関わり、USyd–NUS Ignition GrantとDuke-NUSパーキンソン研究基金などの支援を受けた。
