Virus yang merusak tanaman kapas telah ada di ladang-ladang Amerika sejak setidaknya 2006, jauh lebih awal dari perkiraan sebelumnya. Penelitian baru mengungkapkan bahwa virus leafroll dwarf kapas, yang terdeteksi secara resmi pada 2017, menyebar tanpa terdeteksi di wilayah budidaya utama. Temuan ini menekankan nilai menganalisis ulang data lama untuk mengungkap ancaman pertanian tersembunyi.
Para ilmuwan menemukan bahwa virus leafroll dwarf kapas (CLRDV), yang merusak tanaman kapas di Amerika Serikat bagian selatan, telah menginfeksi ladang sejak 2006. Sebelumnya diasumsikan sebagai pendatang baru setelah deteksi resminya pada 2017, virus ini menyebar diam-diam melalui negara-negara penghasil kapas utama selama hampir dua dekade. Studi yang diterbitkan di jurnal Plant Disease melibatkan peneliti dari USDA Agricultural Research Service dan Universitas Cornell. Dengan memeriksa ulang sampel genetik terarsip dan basis data publik, tim mengidentifikasi CLRDV dalam material dari Mississippi pada 2006, Louisiana pada 2015, dan California pada 2018. Untuk mengonfirmasi keberadaan saat ini, mereka melakukan survei lapangan di California Selatan pada 2023, menandai deteksi resmi pertama negara bagian tersebut. «CLRDV terdeteksi secara resmi pada 2017, jadi diasumsikan baru masuk ke AS,» kata Alejandro Olmedo-Velarde, kini asisten profesor di Iowa State University. «Studi kami menunjukkan bahwa virus ini sebenarnya sudah ada di Cotton Belt negara itu jauh sebelum itu.» Penelitian juga menemukan jejak virus di saluran pencernaan sapi dari studi California, kemungkinan dari pakan berbasis tanaman yang terkontaminasi. Ini menunjukkan penyebaran yang lebih luas sebelum diidentifikasi, meskipun hewan tidak tampak terinfeksi. Temuan ini mungkin menghubungkan CLRDV dengan bronze wilt, penyebab yang diperdebatkan dari kerusakan tanaman jangka panjang. «Sekarang, saat studi lain selaras dengan temuan kami, gagasan itu semakin kuat,» catat Olmedo-Velarde. «Ini bisa menjelaskan kerugian tanaman jangka panjang dan menginformasikan strategi pemantauan virus ke depan.» Dr. Michelle Heck dari Agricultural Research Service menekankan implikasinya bagi petani: «Bagi petani, temuan ini memberikan peringatan dan panggilan untuk bertindak. CLRDV telah ada di ladang AS jauh lebih lama dari yang disadari siapa pun, dan mungkin lebih menyebar daripada laporan saat ini.» Secara keseluruhan, pekerjaan ini menyoroti peran bioinformatika dalam mengungkap penyakit tanaman yang terabaikan melalui data yang ada.
