Des chercheurs au Bangladesh ont identifié un virus transmis par chauves-souris, Pteropine orthoreovirus, chez cinq patients initialement soupçonnés d'infection par le virus Nipah. Tous les patients avaient récemment consommé de la sève de palmier dattier crue, une voie de transmission connue pour les maladies liées aux chauves-souris. Cette découverte met en lumière la nécessité d'une surveillance plus large des menaces zoonotiques émergentes.
Dans une étude publiée dans Emerging Infectious Diseases, des scientifiques ont détecté Pteropine orthoreovirus (PRV) dans des échantillons de prélèvements pharyngés et des cultures virales de cinq patients hospitalisés entre décembre 2022 et mars 2023. Ces individus présentaient des symptômes typiques du virus Nipah, tels que fièvre, vomissements, maux de tête, fatigue, hypersalivation et troubles neurologiques, mais les tests PCR et sérologiques pour Nipah étaient négatifs. Les patients faisaient partie d'un programme de surveillance du virus Nipah géré par l'Institute of Epidemiology, Disease Control and Research (IEDCR) au Bangladesh, l'International Centre for Diarrheal Disease Research, Bangladesh (icddr,b) et les U.S. Centers for Disease Control and Prevention (CDC). En utilisant le high-throughput viral capture sequencing (VCS), une méthode développée au Center for Infection and Immunity de l'Université Columbia, les chercheurs ont détecté le matériel génétique du PRV. Dans trois cas, ils ont réussi à cultiver le virus viable, confirmant des infections actives. Tous les cinq patients avaient consommé de la sève de palmier dattier crue peu avant de tomber malades, une pratique courante en hiver au Bangladesh où les chauves-souris contaminent souvent la sève. Les chauves-souris servent d'hôtes naturels à de nombreux virus zoonotiques, dont Nipah, la rage, Hendra, Marburg et SARS-CoV-1. «Nos résultats montrent que le risque de maladie lié à la consommation de sève de palmier dattier crue va au-delà du virus Nipah », a déclaré Nischay Mishra, PhD, professeur associé d'épidémiologie à la Mailman School of Public Health de l'Université Columbia et auteur principal de l'étude. « Cela souligne également l'importance des programmes de surveillance à large spectre pour identifier et atténuer les risques pour la santé publique posés par les virus émergents transmis par chauves-souris ». Bien que les infections à PRV dans les pays voisins soient généralement plus bénignes, les cas graves au Bangladesh suggèrent l'existence de cas plus légers non diagnostiqués. Un travail récent a identifié un PRV génétiquement similaire chez des chauves-souris près du bassin du fleuve Padma, reliant les réservoirs animaux aux débordements humains. « Cette [recherche] fournit des preuves cruciales reliant les réservoirs de chauves-souris à l'infection humaine », a déclaré Ariful Islam, écologiste des maladies transmises par chauves-souris à Charles Sturt University et co-premier auteur. L'étude, codirigée par Sharmin Sultana de l'IEDCR, a été financée par le U.S. Department of Agriculture. Tahmina Shirin, PhD, directrice de l'IEDCR, a noté : « Une nouvelle cause de débordement zoonotique provoque des complications respiratoires et neurologiques après consommation de sève de palmier dattier crue, en plus de l'infection par virus Nipah ».
