Des chercheurs de l’Université de Californie à San Diego rapportent avoir développé un système de « Génétique proactive » basé sur CRISPR de deuxième génération, appelé pPro-MobV, conçu pour se propager entre les bactéries et désactiver les gènes de résistance aux antibiotiques, y compris à l’intérieur de biofilms difficiles à traiter.
La résistance aux antibiotiques a été décrite par l’UC San Diego comme une crise mondiale de santé accélérée, avec des projections selon lesquelles les « superbactéries » résistantes aux médicaments pourraient être responsables de plus de 10 millions de décès dans le monde chaque année d’ici 2050. L’UC San Diego a indiqué que ce nouveau travail provient des laboratoires des professeurs de l’École des sciences biologiques Ethan Bier et Justin Meyer, qui ont développé une approche semblable à un gene-drive pour les bactéries. Le système —décrit comme une plateforme de Génétique proactive (Pro-AG) de deuxième génération et nommé pPro-MobV— est destiné à se propager à travers les communautés bactériennes et à désactiver les gènes conférant la résistance aux antibiotiques. « Avec pPro-MobV, nous avons transposé la pensée gene-drive des insectes aux bactéries comme outil d’ingénierie des populations », a déclaré Bier dans le récit de l’université. « Avec cette nouvelle technologie basée sur CRISPR, nous pouvons prendre quelques cellules et les laisser neutraliser la RA dans une grande population cible. » Selon l’université, l’idée s’appuie sur un concept Pro-AG antérieur développé en 2019 en collaboration avec le groupe du professeur de l’École de médecine de l’UC San Diego Victor Nizet. Dans ce travail antérieur, un cassette génétique a été introduit dans les bactéries et conçu pour se copier afin d’inactiver les gènes de résistance aux antibiotiques. Le cassette cible les gènes de résistance portés par des plasmides —petites molécules d’ADN circulaire à l’intérieur des bactéries— de sorte que perturber ces gènes peut restaurer la sensibilité aux antibiotiques. Dans la nouvelle version, l’UC San Diego a indiqué que pPro-MobV propage les composants clés de CRISPR par transfert conjugué, un processus comparé à l’accouplement bactérien. Les chercheurs ont rapporté que le système peut se déplacer à travers les biofilms bactériens —communautés denses de microbes difficiles à éliminer— et que ce cadre de biofilm est important car il peut rendre la croissance bactérienne plus difficile à surmonter dans les environnements cliniques et clos. « Le contexte du biofilm pour combattre la résistance aux antibiotiques est particulièrement important car il s’agit de l’une des formes de croissance bactérienne les plus difficiles à vaincre en clinique ou dans des environnements clos tels que les étangs d’aquaculture et les stations d’épuration des eaux usées », a déclaré Bier. « Si vous pouviez réduire la propagation des animaux aux humains, vous pourriez avoir un impact significatif sur le problème de la résistance aux antibiotiques, car environ la moitié est estimée provenir de l’environnement. » L’UC San Diego a également indiqué que des éléments du système peuvent être transportés par des bactériophages —virus qui infectent les bactéries— et que l’équipe envisage pPro-MobV fonctionnant aux côtés de phages en cours d’ingénierie pour combattre la résistance aux antibiotiques. Comme mesure de sécurité supplémentaire, la plateforme peut intégrer un processus de « délétion basée sur l’homologie » destiné à permettre l’élimination du cassette génétique inséré si nécessaire. « Cette technologie est l’une des rares méthodes dont j’ai connaissance qui peut inverser activement la propagation de gènes résistants aux antibiotiques, plutôt que simplement la ralentir ou y faire face », a déclaré Meyer. Le travail a été publié dans npj Antimicrobials and Resistance en 2026 dans un article intitulé « A conjugal gene drive-like system efficiently suppresses antibiotic resistance in a bacterial population. »
