Des chercheurs dirigés par l’Université de Cambridge rapportent qu’un groupe non cultivé de bactéries intestinales connu sous le nom de CAG-170 est plus abondant chez les personnes en bonne santé et moins fréquent dans plusieurs maladies chroniques, sur la base d’une analyse de plus de 11 000 métagénomes intestinaux provenant de 39 pays.
Une grande étude internationale menée par des chercheurs de l’Université de Cambridge a identifié un groupe peu connu de bactéries intestinales — connu sous le nom de CAG-170 — qui apparaît plus fréquemment et à des niveaux plus élevés chez les personnes en bonne santé. Les chercheurs ont recherché l’« empreinte génétique » de CAG-170 dans des données de microbiote intestinal provenant de 11 115 métagénomes couvrant 39 pays. Dans l’ensemble du jeu de données, les individus en bonne santé présentaient des niveaux plus élevés de CAG-170 que les personnes atteintes d’une gamme de maladies non transmissibles. Les résultats ont été publiés dans Cell Host & Microbe. Le jeu de données incluait des participants en bonne santé et des personnes diagnostiquées avec 13 maladies, dont la maladie de Crohn, l’obésité, le cancer colorectal, la maladie de Parkinson et la sclérose en plaques. L’analyse a également révélé des niveaux plus bas de CAG-170 chez les personnes souffrant de conditions telles que la maladie inflammatoire de l’intestin et le syndrome de fatigue chronique. Étant donné que la plupart des membres de CAG-170 restent non cultivés — ce qui signifie que les scientifiques ne peuvent pas encore cultiver la plupart d’entre eux en laboratoire —, l’équipe s’est appuyée sur des analyses computationnelles et génétiques pour déduire ce que les bactéries pourraient faire. Ces analyses ont suggéré que CAG-170 a la capacité de produire de grandes quantités de vitamine B12 et porte des enzymes impliquées dans la dégradation des glucides, des sucres et des fibres. Les chercheurs ont déclaré que la vitamine B12 produite par CAG-170 soutient probablement d’autres microbes bénéfiques dans l’intestin plutôt que de bénéficier directement à l’hôte humain, indiquant un rôle potentiel dans le maintien de l’équilibre à travers l’écosystème intestinal plus large. Le Dr Alexandre Almeida, du Département de médecine vétérinaire de l’Université de Cambridge, qui a dirigé l’étude, a déclaré : « Notre travail a révélé que les bactéries CAG-170 — partie du ‘microbiote caché’ — semblent être des acteurs clés dans la santé humaine, probablement en nous aidant à digérer les principaux composants de notre alimentation et en maintenant tout le microbiote en bon fonctionnement. » Il a ajouté : « Nous avons examiné les microbes intestinaux de milliers de personnes dans 39 pays et 13 maladies différentes, y compris Crohn et l’obésité. Nous avons systématiquement constaté que les personnes atteintes de ces maladies avaient des niveaux plus bas de bactéries CAG-170 dans leur intestin. » L’étude s’appuie sur des efforts antérieurs pour cartographier la diversité génétique du microbiote intestinal humain, y compris le travail d’Almeida sur le catalogue Unified Human Gastrointestinal Genome (UHGG). Ce catalogue a compilé des génomes de référence représentant des milliers d’espèces procaryotes intestinales, dont beaucoup manquent de représentants cultivés. Dans cette nouvelle recherche, l’équipe a rapporté que trois analyses distinctes soutenaient le lien de CAG-170 avec la santé : comparaisons entre cohortes saines et malades, évaluations des microbes les plus stabilisants au sein des microbiotes sains, et analyses de la dysbiose — un état de déséquilibre du microbiote intestinal associé dans les recherches passées à des conditions à long terme, y compris le syndrome de l’intestin irritable, la polyarthrite rhumatoïde, et l’anxiété et la dépression. Les chercheurs ont déclaré que CAG-170 pourrait finalement aider à définir à quoi ressemble un microbiote intestinal sain et pourrait servir de marqueur futur de santé intestinale. Ils ont également suggéré que, si les scientifiques apprennent à cultiver ces bactéries et à les tester directement, les résultats pourraient informer des approches probiotiques plus ciblées que celles couramment utilisées aujourd’hui. L’intestin humain contient des milliards de bactéries couvrant des milliers d’espèces. Bien que la composition varie largement d’une personne à l’autre, les chercheurs ont déclaré que la fonction globale du microbiote vise principalement à soutenir les processus corporels normaux.
