Para ilmuwan menggunakan pengujian DNA untuk mengidentifikasi sumber tanaman madu, mendeteksi pemalsuan, dan mengungkap patogen sarang lebah. Metode ini membantu membedakan madu lokal murni dari produk impor atau yang tercemar sirup. Kemajuan dalam pengurutan genetik membuat deteksi ini lebih akurat dan mudah diakses.
Jay Evans, dari USDA Beltsville Bee Lab, mengeksplorasi bagaimana sidik jari DNA dalam madu memberikan wawasan di luar hanya asal tanaman. Jejak-jejak ini dapat mengidentifikasi ras lebah, patogen, parasit, dan bahkan jejak dari pengunjung sarang atau pemanen. Dikombinasikan dengan tes kimia untuk pestisida dan aditif, analisis DNA memperkuat upaya melawan penipuan madu. Pada pertemuan Federasi Peternak Lebah Amerika 2026, peternak lebah Jerman Bernhard Heuvel mempresentasikan deteksi penipuan menggunakan kolaborasi ilmiah Eropa. Kerjanya menyoroti perlombaan senjata yang sedang berlangsung antara penipu dan penyelidik, di mana metode kimia semakin dihindari, tetapi DNA menawarkan pendekatan yang lebih kuat. Identifikasi serbuk sari tradisional melalui mikroskop memiliki keterbatasan, tetapi barcode DNA menargetkan gen tanaman spesifik untuk sumber yang tepat. Studi Inggris 2025 oleh Sophie Dodd dan rekan-rekannya menggunakan ini untuk mendeteksi pemalsuan sirup jagung dan beras pada tingkat 1% dalam madu. DNA beras, yang tidak ada di flora Inggris, dengan jelas menunjukkan pencampuran dengan sirup asing. Sekuensing DNA shotgun memeriksa semua materi genetik dalam madu, mengatasi bias dalam tes gen tunggal. Studi Italia 2018 oleh Samuele Bovo dan timnya mengonfirmasi sumber tanaman yang diberi label dan mengidentifikasi patogen lebah seperti virus dan ngengat lilin. Lebih baru lagi, Priit Paluoja dan rekan-rekannya menganalisis hampir 400 madu Estonia pada 2025, memverifikasi keragaman tanaman untuk pelacakan geografis dan mendeteksi bakteri American foulbrood, terutama di koloni yang sakit. Metode ini menunjukkan tidak ada kumbang sarang kecil di sampel Estonia tetapi jejak di madu AS, membantu pemantauan hama invasif. Saat biaya sekuensing turun dan alat komputasi membaik, teknik ini menjanjikan perlindungan yang lebih baik untuk madu asli dan pemahaman yang lebih dalam tentang kesehatan lebah.