لقد حدد الباحثون فئة جديدة من RNA غير مشفرة يتيمة تُدعى oncRNAs، والتي تظهر عبر أنواع متنوعة من السرطان وتشكل توقيعات جزيئية فريدة. هذه الجزيئات لا تحدد نوع السرطان وفرعيته بدقة عالية فحسب، بل تدفع نمو الورم في بعض الحالات أيضًا. وجودها في مجرى الدم يوفر إمكانية لإجراء اختبارات دم بسيطة لمراقبة استجابة العلاج والتنبؤ ببقاء المريض.
بدأ الاكتشاف في عام 2018 مع T3p، وهي جزيء RNA صغير تم العثور عليه في سرطان الثدي لكنه غائب في الأنسجة الطبيعية. أثار هذا الاكتشاف غير العادي جهدًا بحثيًا استمر ست سنوات لاستكشاف RNA غير مشفرة يتيمة مشابهة تُدعى oncRNAs في الأنواع الرئيسية من السرطان. شملت الدراسة، التي نُشرت في Cell Reports Medicine، تحليل بيانات تسلسل RNA الصغيرة من The Cancer Genome Atlas عبر 32 نوعًا من السرطان، مكشفة حوالي 260,000 RNA صغيرة خاصة بالسرطان موجودة في كل نوع تم فحصه. أظهر كل سرطان أنماط تعبير oncRNA مميزة. على سبيل المثال، أظهرت سرطانات الرئة oncRNAs مختلفة مقارنة بسرطانات الثدي. صنفت نماذج التعلم الآلي باستخدام هذه الأنماط أنواع السرطان بدقة 90.9% في مجموعة البيانات الأولية و82.1% في مجموعة منفصلة من 938 ورمًا. داخل سرطان الثدي، اختلفت أنماط oncRNA بين الأنماط الفرعية القاعدية والصمامية، تعمل كـ«باركود جزيئي رقمي» يلتقط هوية الورم والفرعية والحالة الخلوية. لتقييم الأدوار الوظيفية، فحص الباحثون حوالي 400 oncRNA من أورام الثدي والقولون والرئة والبروستاتا. باستخدام متجهات فيروسات لنتي في خلايا سرطانية مزروعة في الفئران، وجدوا أن حوالي 5% تؤثر على نمو الورم. تم دراسة oncRNAين لسرطان الثدي بالتفصيل: واحد أحدث انتقالًا من الظهارة إلى الوسيط، مما يساعد على الانتشار، بينما الآخر فعّل جينات هدف E2F لتعزيز التكاثر. كلاهما سرّع نمو الورم والاستعمار السرطاني في النماذج، مع تغييرات مماثلة في المسارات المرصودة في بيانات أورام المرضى من TCGA. برز رؤية سريرية رئيسية من إفراز oncRNAs إلى مجرى الدم. أظهر تحليل RNA خالية من الخلايا من 25 خط خلايا سرطانية عبر تسعة أنواع أنسجة أن حوالي 30% تُفرز بنشاط. في عينات مصل من 192 مريضًا بسرطان الثدي في تجربة I-SPY 2، ارتبطت مستويات عالية متبقية من oncRNA بعد العلاج الكيميائي النيوadjuvant ببقاء عام أسوأ بنحو أربعة أضعاف، حتى بعد تعديل المؤشرات السريرية القياسية. يعالج هذا النهج تحديات مراقبة المرض المتبقي الدنيا، حيث قد توفر إفرازات RNA إشارات أوضح من DNA. يتعاون الفريق، بما في ذلك Hani Goodarzi، مع Exai Bio لتطوير تشخيصات قائمة على oncRNA باستخدام نماذج الذكاء الاصطناعي. تبرز النتائج oncRNAs كمحركات للمرض وبيوماركرز، مع توفير الموارد مفتوحة للبحوث الإضافية.
