L'Union internationale pour la conservation de la nature a ajouté les manchots empereurs et les otaries à fourrure antarctiques à sa liste des espèces menacées suite à un net déclin de leur population. Le statut de l'éléphant de mer du sud est passé de préoccupation mineure à vulnérable. Les autorités attribuent ces changements principalement au changement climatique et aux maladies.
La Liste rouge de l'UICN classe désormais le manchot empereur (Aptenodytes forsteri) et l'otarie à fourrure antarctique (Arctocephalus gazella) comme espèces en danger. Les données satellites indiquent une baisse de 10 % du nombre de manchots empereurs entre 2009 et 2018, affectant plus de 20 000 adultes. Les projections indiquent que la population pourrait être divisée par deux d'ici les années 2080 en raison de l'évolution des modèles de glace de mer due au changement climatique d'origine humaine, selon Philip Trathan du British Antarctic Survey et membre de la Commission de sauvegarde des espèces de l'UICN. Il a déclaré : « La débâcle précoce de la banquise au printemps affecte déjà les colonies autour de l'Antarctique, et de nouveaux changements dans la banquise continueront d'affecter leur habitat de reproduction, d'alimentation et de mue. »