Des chercheurs ont créé la première carte complète des mutations du gène CTNNB1 influençant le développement des tumeurs. En testant tous les changements possibles dans un point chaud critique, ils ont révélé des effets variables sur les signaux cancéreux. Les résultats correspondent aux données des patients et suggèrent des implications pour l'immunothérapie.
Une équipe de scientifiques a développé une carte détaillée illustrant comment les mutations dans le gène CTNNB1, qui code la protéine β-caténine, impactent la croissance tumorale. La β-caténine régule normalement la croissance et la réparation des tissus, mais lorsque son contrôle échoue en raison de mutations, les cellules prolifèrent de manière incontrôlée, une caractéristique du cancer. L'étude s'est concentrée sur un petit point chaud dans CTNNB1 où plus de 70 mutations ont été observées dans divers cancers. Dans cette région, les mutations empêchent typiquement la dégradation de la β-caténine, lui permettant de s'accumuler et d'activer des gènes favorisant les tumeurs. En utilisant des cellules souches de souris, des chercheurs de l'Université d'Édimbourg ont testé les 342 mutations d'une seule lettre possibles dans le point chaud. Des techniques avancées d'édition génomique et une lecture fluorescente ont mesuré l'effet de chaque mutation sur la voie de signalisation β-caténine, qui régit la croissance cellulaire. Les résultats ont montré une large gamme : certaines mutations ont causé des augmentations mineures d'activité, tandis que d'autres ont amplifié dramatiquement les signaux. Comparées aux données génétiques de milliers de patients atteints de cancer, les prédictions de la carte correspondaient aux comportements réels. Notamment, les tumeurs dans différents tissus sélectionnent des mutations produisant des niveaux spécifiques d'activité β-caténine, indiquant que l'emplacement façonne les préférences mutationnelles. Dans le cancer du foie, des mutations plus faibles de CTNNB1 étaient corrélées à une plus grande présence de cellules immunitaires, tandis que les plus fortes en montraient moins. Cette différence pourrait influencer les réponses à l'immunothérapie. Andrew Wood, investigateur principal à l'Institute of Genetics and Cancer de l'Université d'Édimbourg, a déclaré : « La nouvelle carte fournit un outil puissant pour prédire comment des mutations spécifiques de CTNNB1 affectent le comportement du cancer et pourrait soutenir le développement de traitements plus personnalisés. En tant que première étude à tester expérimentalement chaque mutation possible dans ce point chaud critique, elle donne aux scientifiques une image plus claire de la manière dont la β-caténine stimule la croissance tumorale dans différents types de cancer. » La recherche, codirigée par des équipes de l'Université d'Édimbourg, du Leiden University Medical Center et de l'Université Koç, paraît dans Nature Genetics. Elle a reçu un financement du Medical Research Council et du Biotechnology and Biological Sciences Research Council.